Android verliert nach jedem Neustart Startvorgaben, App-Einstellungen und installierte Updates und installierte Apps

Nach jedem Neustart verliert Android die Startvorgaben, einige App-Einstellungen und sogar einige der installierten Updates und installierten Apps.

Ich habe die Standard-Firmware erneut geflasht und dann alle OTA-Updates angewendet. Danach habe ich nur noch TWRP, GApps (Pico Uni) und SuperSU geflasht.

Vor diesem Hintergrund habe ich mehrere Werksresets (aus den Einstellungen) versucht, aber jedes Mal, nachdem einige Apps installiert wurden, verschwinden einige der oben genannten bei jedem Neustart. Da ich die Reihenfolge der installierten Apps variiert habe, sind die verlorenen Daten jedes Mal etwas anderes. Beispiele für verschiedene Factory Resets sind:

• verlorene Standard-App für die Suche auf der Home-Schaltfläche tippen und ziehen
• Standard-App für Browser verloren
• verlorene Gmail-Einstellungen (globale) und/oder Account-Sync-Flag
• Updates von Motorola Camera und Motorola Gallery (über Play Store)
• Einige der Apps, die ich gerade installiert habe (über den Play Store), verschwinden nach dem Neustart
• Der interne Speicher wird für Apps (auch gerootete) schreibgeschützt, bleibt aber für Android File Transfer beschreibbar

Was ich bisher versucht habe:

• Cache und Dalvik-Cache löschen - eigentlich nach fast jeder installierten App und natürlich nach dem Zurücksetzen auf die Werkseinstellungen
• jede betreffende App deinstallieren und neu installieren
• manuelles Zurücksetzen der App-Standardeinstellungen in Einstellungen>Apps, sowohl global als auch für einzelne Apps
• Keine der Apps ist auf SD / internem Speicher installiert, daher sollte dies kein Problem sein

Was ich nicht probiert habe sind:

• Löschen des internen Speichers und der SD-Karte (die meisten Apps wurden zuvor "auf SD verschoben")
• Unabhängig davon, ob Sie die Android-Partitionen neu formatieren oder neu partitionieren

Irgendwelche Ideen, was man als nächstes versuchen könnte?

Ich habe ein Moto G der 2. Generation (XT1079 Dual-SIM). Es läuft mit automatisch aktualisiertem Android von Stock 5.0.2 22.36.1 (Build LXB22.99-7.1) auf Stock Lollipop 5.0.2 22.46.7 (Build LXB22.99-24.7).