Nach Order 66 kehrten Yoda und Obi-Wan zum Jedi-Tempel zurück und fanden ihn von Klonen besetzt vor. Sie versuchen nicht, sich einzuschleichen, sondern greifen offen an und töten eine Anzahl von Klonen. Danach untersuchen sie relativ gemächlich den Tatort, suchen nach Hinweisen, kalibrieren Nachrichten für verbliebene Jedi neu, schauen sich Holo-Aufnahmen an etc..
Da wir wissen, dass Klontruppen über Kommunikationsausrüstung verfügen, wäre es sicher anzunehmen, dass sie andere gewarnt haben, dass sich zwei Jedi im Tempel befinden (und sie wahrscheinlich den Großmeister des Ordens erkannt haben) und Verstärkung angefordert haben. Da keine neuen Klone auftauchen, während Yoda und Obi-Wan im Tempel spazieren, kann man davon ausgehen, dass zwei Jedi vorübergehend den ganzen Tempel (oder zumindest einen Teil davon) erobert haben, indem sie alle Klontruppen in der Nähe eliminiert haben?
Die offizielle Novellierung des Films weist darauf hin, dass zu der Zeit, als Yoda und Obi-Wan den Tempel infiltrierten, Tausende von bewaffneten Klontruppen vor Ort waren, die regelmäßig Angriffen von verschiedenen Jedi ausgesetzt waren, die sich noch immer versteckt hielten.
Tausende Klontruppen stürmten den Jedi-Tempel. Mehrere Bataillone auf jeder Ebene waren nicht nur eine Besatzungsmacht, sondern auch an dem langen, mühsamen Prozess beteiligt, Leichen für eine eindeutige Identifizierung vorzubereiten. Die toten Jedi sollten mit den in den Tempelarchiven geführten Listen gezählt werden; die toten Klons würden mit den Regimentslisten abgeglichen. Für alle Toten musste Rechenschaft abgelegt werden.
Dies stellte sich als etwas komplizierter heraus, als die Klonoffiziere erwartet hatten. Obwohl die Kämpfe schon vor Stunden beendet waren, tauchten immer wieder Soldaten auf, die vermisst wurden. Normalerweise kleine Patrouillentrupps – fünf Soldaten oder weniger –, die immer noch willkürlich durch die Korridore des Tempels fegten und jede Tür und jedes Fenster, jeden Schreibtisch und jeden Schrank überprüften.
Star Wars Episode III: Die Rache der Sith – Offizielle Novellierung
Es ist nicht besonders klar, ob die Soldaten am Vordereingang schon als vermisst aufgefallen waren, aber selbst wenn sie es gewesen wären, wäre ein Jedi, der in den Tempel geht, nicht die erste Vermutung der Soldaten gewesen. Sie wären mehr daran interessiert, dass die Jedi im Inneren entkommen.
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