Welche Signalprozessoren umfassen ein ereignisbezogenes Potenzialsystem für EEG?

Mein 30.000-Fuß-Verständnis des Datenflusses der EEG-Signalverarbeitung ist also:

  1. Erfassen Sie EEG-Rohdaten ("Rohwellenformen")
  2. Führen Sie diese Rohwellenformen durch ein Signalverarbeitungs-Framework , das aus 1+ "Knoten"/Prozessoren besteht, wobei jeder Prozessor eine Art Transformation der Rohwellenform durchführt. Dadurch werden neue Informationen aus der zuvor verborgenen Rohwellenform freigesetzt
  3. Führen Sie individuelle Analysen dieser freigeschalteten Daten durch, je nachdem, was zu Ihrer Forschung/Anwendung passt

Also zunächst einmal, wenn das obige Verständnis in irgendeiner Weise in die Irre geführt wird, beginnen Sie bitte damit, mich zu korrigieren!

Angenommen, ich liege mehr oder weniger richtig, besteht meine spezifische Anwendung darin, dass ich bestimmte Rohwellenformen mit Ereignissen korrelieren möchte (z. B. " an eine Schildkröte denken ", " Kopf auf und ab bewegen " usw.). Ich glaube, ereignisbezogene Potenziale sind das, wonach ich suche, aber...

Womit ich zu kämpfen habe, ist: Wie muss mein „Signal Processing Network“ aussehen, um ERP zu implementieren? Aus architektonischer Sicht suche ich nach diesem "Netzwerk", um rohe Wellenformen als Eingabe aufzunehmen und Ereignisse auszugeben, wie die wenigen, die ich oben erwähnt habe.

Ist FFT hier ein Akteur? Einige Arten von Filtern? Aus welchen Prozessoren besteht ein ERP-System und wie sieht ihr jeweiliges „Netzwerk“ (Data Flow Pipeline) aus?

Danke @daniel - wenn du sagst " natürlich werden die Daten vom Zeit- in den Frequenzbereich transformiert ", warum sagst du dann " natürlich "? Was kann durch die Betrachtung der Daten im Frequenzbereich gegenüber der Betrachtung im Zeitbereich gewonnen werden?
Insbesondere besteht das Ziel oft darin, eine Vorstellung von den unterschiedlichen Frequenzen zu bekommen, aus denen ein komplexes Signal besteht, und wenn das Signal wirklich komplex ist, kann es unmöglich sein, diese Informationen durch Beobachtung des Zeitsignals zu erhalten.
Danke @daniel – bleiben wir bei deinem Pulsbeispiel. Sie sagten: "Sie suchen normalerweise nach dem durchschnittlichen Verhalten eines Signals im Laufe der Zeit." Können Sie ein konkretes Beispiel für ein solches "Verhalten" des menschlichen Herzens geben, das beobachtet werden kann, indem Herzfrequenzdaten (im Zeitbereich beobachtet) durch FFT laufen und in den Frequenzbereich transformiert werden?
Sicher, können Sie ein konkretes Beispiel geben , bei dem die Zerlegung einer ursprünglichen Wellenform in komponentenfrequenzbasierte Wellenformen mehr umsetzbare Informationen liefert als die ursprüngliche Wellenform? Überhaupt ein Beispiel, aber ein konkretes Beispiel?
Nochmals vielen Dank @daniel, aber ich sehe den Wert davon einfach (noch) nicht. Nehmen wir Ihr Geigenbeispiel. Wenn wir bereits wissen, wie die Geige klingt, warum zerlegen wir sie dann in ihre Hauptfrequenzkomponenten? Um den Klang der Geige zu rekonstruieren?!? Wir hatten den Sound an erster Stelle! Für mich ist das so, als würde man sagen: Lasst uns einen Automotor zerlegen, damit wir alle seine Einzelteile haben … damit wir dann den Automotor wieder zusammenbauen können … und wir selbst einen Automotor haben! Nein, den Automotor hattest du schon vorher!
Beachten Sie, dass die Terminologie unkonventionell ist; Das Filtern ist typischerweise ein serieller Prozess, insbesondere im EEG. Zweitens ist ein Prozessor hauptsächlich mit Hardware verbunden, z. B. einer CPU.
@smeeb Kannst du bitte deinen Schritt (2) erweitern? Es ist zu unspezifisch. Bitte geben Sie konkrete Beispiele, was Sie zu tun versuchen.

Antworten (2)

Ereignisbezogene Potenziale sind in vielen Aspekten der Physiologie ein Thema, nicht nur in der EEG-Analyse, daher ist diese Antwort allgemeiner.

Das Hauptproblem besteht darin, dass elektrische oder andere Signale, die einem „Ereignis“ zugeordnet sind, typischerweise eine viel geringere Größe haben als das Hintergrundrauschen in dem untersuchten System. Elektrokardiogramme sind in dieser Hinsicht die Ausnahme. Die Kunst besteht dann darin, das ereignisbezogene Signal aus dem Rauschen herauszuholen.

Dies geschieht durch mehrfache Wiederholung des "Ereignisses" kombiniert mit Signalmittelung . Sie markieren die elektrische Aufzeichnung mit der Zeit jedes Ereignisses, richten Teile der Aufzeichnung an den Ereignismarkierungen aus und mitteln die aufgereihten Signale um die mehreren Ereignisse herum. Dies kann die vollständige Wellenform für sensorisch evozierte Potenziale sein oder, wenn Sie Aktionspotenziale in einem Nerv untersuchen, das Histogramm der Zeitpunkte des Auftretens von Aktionspotenzialen nach dem Ereignis .

Die speziellen Signalverarbeitungsmechanismen, die verwendet werden, haben sich mit der Technologie entwickelt. Ich bin alt genug, um Leute zu kennen, die vor 60 Jahren elektrische neuronale Aktivität auf Magnetband aufgezeichnet und die Daten nach der Analog-Digital-Wandlung auf damals hochmodernen Computern mit 65.000 Wörtern Speicher verarbeitet haben. Schon damals gab es Diskussionen über die besten Technologien für bestimmte Zwecke, wie diese MIT-Monographie von 1959 zeigt.

Das Hauptproblem, der geringe Pegel ereignisbezogener Signale gegenüber dem Rauschen anderer elektrischer Aktivitäten, besteht auch 60 Jahre später noch. Das Rauschen ist eher biologisch als technisch, daher haben neuere Verbesserungen eher mit der Leichtigkeit und Geschwindigkeit der Verarbeitung zu tun als mit dem grundlegenden Signal-Rausch-Problem. Verwenden Sie für ereignisbezogene Potenziale jede Technologie, die es Ihnen ermöglicht, die elektrischen Daten zusammen mit verknüpften Notationen der Ereigniszeiten zu sammeln und dann die mit den Ereignissen synchronisierten Signale zu mitteln, um das Signal aus dem Rauschen aufzubauen. Bei einer klinischen Standardanwendung von akustisch evozierten Hirnstammpotenzialen zur Bewertung des Hörvermögens müssen Sie möglicherweise über 500 oder mehr Stimuluspräsentationen mitteln.

Dieses Signal-in-Rausch-Problem wird auch in der funktionellen Magnetresonanztomographie (fMRI) der Gehirnfunktion gesehen, die nicht nur das Signal über die Zeit, sondern auch Unterschiede zwischen Gehirnregionen innerhalb von Individuen und Unterschiede zwischen Individuen berücksichtigen muss. Die Wikipedia-Seite zu fMRI geht detailliert auf Methoden ein, um bestimmte Signale aus dem Hintergrundrauschen herauszuholen. Besondere Aufmerksamkeit sollten Sie dem Thema „Block versus eventbezogenes Design“ auf dieser Seite widmen. Mein Verständnis ist, dass für "Ereignisse" der Art, die Sie in Betracht ziehen, wie "an eine Schildkröte denken", das Blockdesign in fMRI am besten funktioniert. Das Papier von Thierry et al ., bereitgestellt in der hilfreichen Antwort von @Christiaan,

Die Methoden in dieser Arbeit von Thierry et al. weisen auch auf die Art der praktischen Sorgfalt hin, die bei professionellen Analysen dieser Art angewendet wird. Die Autoren gehen detailliert auf die Art und Platzierung der Elektroden, die Auswahl der für die Analyse zu verwendenden Elektroden, die Signalabtastraten und so weiter ein. Zum Beispiel:

Die Kopfhautaktivität wurde mit einer Abtastrate von 1 kHz von 64 Ag/AgCl-Elektroden digitalisiert, die gemäß der 10–20-Konvention über die Kopfhaut verteilt waren, wobei Cz als Referenz verwendet wurde. Impedanzen wurden unter 7 kOhm gehalten. Das Elektroenzephalogramm wurde online zwischen 0,01 und 200 Hz und offline bei 35 Hz tiefpassgefiltert, wobei ein digitales Filter mit Nullphasenverschiebung verwendet wurde. Augenblinzelartefakte wurden mathematisch korrigiert und Signale überschritten ± 75 μ V in jeder gegebenen Epoche wurden automatisch verworfen.

Das Lesen von Artikeln wie diesem ist wahrscheinlich der beste Weg, um zu erfahren, worum es geht, und um Leute zu finden, die Ihnen beibringen können, wie man es macht.

Dies scheint mir eine vernünftige Antwort zu sein. Spielt die Filterung dabei eine Rolle?
@daniel, Filterung ist all dieser Signalverarbeitung inhärent, da jedes echte Aufnahmesystem eine begrenzte Bandbreite hat und diese Bandbreite das interessierende Signal enthalten muss. Bei dieser Art von Anwendung ist die elektrische Aufzeichnung typischerweise AC-gekoppelt, so dass niederfrequente Signale (z. B. Drift) wegfallen. Wenn die spezielle Wellenform der Antwort bekannt ist, könnte eine Filterung zur Hervorhebung ihrer Frequenzkomponenten hilfreich sein, aber die Haupttechnik besteht in mehreren Wiederholungen des Ereignisses und Mittelung der mehreren Signale, nachdem sie nach Ereigniszeiten aufgereiht wurden.
Vielen Dank für die großartige Antwort @EdM (ich würde sie positiv bewerten, wenn ich den Vertreter dazu hätte)! Es hört sich also so an, als ob die beiden Hauptprobleme mit "rohen" EEG-Daten sind: (1) Signal-Rausch-Verhältnis (was ein seit langem bestehendes Problem ist, da der Großteil des Rauschens vom eigenen Körper der Testperson kommt) und ( 2) Verwenden von Tricks wie FFT (sowie anderen), um mehr Informationen zu erhalten, als in der ursprünglichen Wellenform vorhanden waren. Können Sie diese Aussagen bitte bestätigen und mich korrigieren, wenn ich etwas falsch verstehe oder übersehe? Danke noch einmal!
FFTs "enthüllen nicht mehr Informationen als in der ursprünglichen Wellenform vorhanden waren", sie helfen lediglich, unter bestimmten Umständen ein Signal aus dem Rauschen herauszuholen. Das ist wirklich ein wichtiger Unterschied; Die Informationen sind da, aber Sie müssen sie finden. Ja, Signal-zu-Rauschen ist das Hauptproblem. Für Ihre Anwendung kann die Signalmittelung im Zeitbereich wichtiger sein als die Frequenzbereichsanalyse mit FFT, es sei denn, Sie kennen die Frequenzeigenschaften des gesuchten Signals.
Danke für die Klarstellung @EdM - also nur um ein für alle Mal zu bestätigen, dass ERPs typischerweise durch Mittelung der "rohen" (unverarbeiteten) EEG-Wellenformen durchgeführt werden? Und dass es keine anderen "Tricks of the Trade" (Filter, vielleicht andere Signalverarbeitungstransformationen usw.) gibt, die auf diese Rohdaten angewendet werden? Danke noch einmal!
In der Praxis gibt es wirklich keine "unverarbeitete" elektrische Wellenform, da jedes reale Aufnahmegerät immer einen bestimmten Frequenzbereich auswählt. Es gibt sicherlich einige „Tricks of the Trade“ im Allgemeinen, wie man qualitativ hochwertige Daten sammelt, und es kann einige spezifische Optionen für zusätzliche Filter für bestimmte Anwendungen geben, aber das ist nicht mein professionelles Fachgebiet. Wenn Sie so etwas machen wollen, arbeiten Sie mit jemandem zusammen, der praktische Erfahrung hat.
@EdM Können Sie ein Codeprojekt / eine Website angeben, die die Ereigniserkennung durch Mittelung einer Form oder das Studium von Histogrammen durchführt? Ich würde gerne besser verstehen, wie sie die Signalerkennung handhaben. Ich möchte das gesamte Signal zeitlich einbeziehen (nicht nur Intervalle). Gerstein 1960 + Arieli 2006 + Urner 2013 zeigen, dass das Rauschen auch physiologisch bedeutsame Details enthält. Ich würde wirklich gerne verstehen, wie man das Herausfiltern physiologischer Daten, dh einiger Rauschelemente, vermeiden kann. Verstehen Sie dann, wie die Situation mit Herzsignalen ist. Wie viel Rauschen ist in EKG-Signalen physiologisch?
@Masi: EKG-Signale sind normalerweise sehr groß mit minimalem Rauschen, wenn Elektroden richtig angebracht sind und hochwertige Elektronik verwendet wird. Ich weiß nicht, dass in ihnen viel "physiologisches" Rauschen zu finden ist. Der allgemeinere Fall liegt außerhalb meiner derzeitigen beruflichen Expertise, da ich seit vielen Jahren nicht mehr über Signalverarbeitung nachdenken musste. Ich erinnere mich, dass die Wavelet-Analyse nützlich sein kann, um Signale einer bestimmten Form in einem verrauschten Signal auf eine Weise zu finden, die der Fourier-Analyse überlegen ist, aber ich habe keine direkte Erfahrung damit.
@EdM Angenommen, Sie sehen ein Signal in Ihrer Wavelet-Analyse/Fourier-Analyse. Wie bestätigen Sie, dass es sich wirklich um ein Signal als um Artefakte handelt? Ergebnisse der Wavelet-Analyse sind selbst sehr verrauscht.
@Masi: Entschuldigung, das übersteigt mein Fachwissen. Probieren Sie die Stack Exchange Signal Processing -Site aus, um fundiertere Antworten zu erhalten.

ERPs werden typischerweise in Bezug auf Amplitude und Latenz analysiert. FFT ist nicht wirklich eine Option; es macht keinen Sinn. Es kann einige Anwendungen geben, bei denen es nützlich sein kann, aber diese sind ziemlich spezifisch. Wenn beispielsweise wiederholte Stimuli präsentiert werden und Sie sie nicht mitteln, aber Sie ein EEG erfassen, kann Ihnen die FFT dabei helfen, abzuleiten, ob die Stimulusfrequenz (z. B. 1/s) mit der Antwortfrequenz übereinstimmt und wie groß die Phasendifferenz zwischen ihnen ist . Beachten Sie, dass FFT Amplituden- und Phasendaten liefert. Aber im Allgemeinen werden ERPs einfach analysiert, indem Amplitude und Latenz genommen werden (Abb. 1).

ERP-Analyse
Abb. 1. ERPs werden durch Aufnahme der Spitzen charakterisiert, hier die positive Spitze (P) bei 100 ms (P1) und die negative Spitze (N) bei 170 ms (N170). Die Amplitude des N170-Peaks wurde analysiert und aufgetragen. Quelle: Thierry et al ., (2007)

Referenz
Thierry et al ., Nature Neuroscience (2007); 10 : 505-11

Wie immer nochmals vielen Dank @Christiaan! Bitte sehen Sie sich meinen letzten Kommentar/Folgefrage unter der Antwort von EdM an ... Ich habe dieselbe Frage an Sie! Vielen Dank!
@smeeb - Filtern ist nur notwendig, wenn es notwendig ist. Wenn nicht, ist es nicht :)
...Die schnelle Fourier-Transformation (FFT) von EEG-Daten ist ...eine Neuformatierung von Daten in Komponentenfrequenzen. Diese Transformation ist nützlich, da viele pathologische EEG-Muster spektrale Muster erzeugen, die leicht erkannt werden können, ohne dass das umfangreiche Training erforderlich ist, um routinemäßige EEG-Aufzeichnungen zu interpretieren ... Aus der Zusammenfassung dieses Artikels . FFT ist eindeutig sinnvoll und wird in einigen Fällen durchgeführt.
QEEG [FFT/Wavelet-Analyse] wurde für die klinische Anwendung in einigen Bereichen, wie z. B. zerebrovaskulären Erkrankungen und Epilepsie, akzeptiert, obwohl es in anderen klinischen Bereichen, wie z. B. der Diagnose leichter traumatischer Hirnverletzungen oder psychiatrischer Erkrankungen, noch akzeptiert werden muss. en.wikipedia.org/wiki/Quantitative_electroencephalography .
@daniel - das ist EEG, nicht ERP; Frage & Antwort sind auf ERP
Ja das sehe ich jetzt. Ich habe mich auf EEG konzentriert und sehe, dass FFT im ERP-Kontext keine große Bedeutung hat - danke.