Wie kann ich aus probtrackX von FSL generierte DTI-Traktographie-Stromlinien in 3D visualisieren?

Ich habe derzeit Track-Dateien mit DTI-Daten (Diffusion Tensor Imaging), die mit dem Traktographie-Tool probtrackX von FSL generiert wurden. Was ist die beste Software, um die Stromlinien von FSL in 3D zu visualisieren?

Ich stoße auf das gleiche Problem bei der Visualisierung der von FSL generierten Traktographie. Ich möchte fragen, ob Sie einen geeigneten Weg finden, um das Problem zu lösen. Ich würde mich freuen, wenn Sie mir dazu einen Hinweis geben könnten. Ich danke dir sehr.
Soweit ich weiß, wird kein Streamline-Objekt generiert. Ich denke, der beste Weg, sie zu visualisieren, wäre, die Datei fdt_paths.nii und den entsprechenden Schwellenwert zu verwenden. Das sind die Voxel, die von Stromlinien durchquert werden.

Antworten (1)

Ich muss sagen, ich bin kein Experte, aber die folgenden Quellen sehen hilfreich aus:

Der Voxelwert im resultierenden Datensatz stellt die Anzahl der Stromlinienproben dar, die durch dieses Voxel laufen, multipliziert mit der erwarteten Länge dieser Proben. Das probabilistische Traktographie-abgeleitete DDM wurde erzeugt, indem die Werte dieser Voxel gehalten wurden, die sich an der WGM-Schnittstelle befinden, und die verbleibenden Voxel auf Null gesetzt wurden. Auch hier wurden die DDMs auf der 3D-WGM-Schnittstelle im DTI-Raum gerendert.

Referenzen
- Catani & Thiebaut de Schotten, Cortex (2008); 44 (8): 1105–32
– Gao et al ., PLoS ONE (2013); 8 (10): e75065

Wie kann ich aus probtrackX von FSL generierte DTI-Traktographie-Stromlinien in 3D visualisieren?
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