Kann ein dNTP in einen RNA-Strang eingebaut werden?

DNA besteht aus Desoxyribonukleotiden, RNA besteht aus Ribonukleotiden. Sie unterscheiden sich hauptsächlich (abgesehen vom Uracil/Thymin-Unterschied) im Zuckeranteil, der Desoxyribose und der Ribose. Diese beiden Moleküle unterscheiden sich in der Hydroxygruppe in der Ribose, die in der Desoxyribose nur ein einziges Proton ist. Dieser Teil des Zuckermoleküls ist nicht direkt an Bindungsreaktionen beteiligt, verursacht aber dennoch den ganzen Unterschied zwischen RNA und DNA.

Ich frage mich: Könnte ein dNTP in einem RNA-Strang verwendet werden (oder umgekehrt)? Ist es chemisch möglich, dass wir ein RNA-Molekül haben, das neben seinen NTPs ein dNTP enthält?

Interessiert es Sie, ob dies auf natürliche Weise geschieht oder ob wir es im Labor tun können? Und je nachdem, welche Wechselwirkungen Sie meinen, ist es nicht wirklich richtig zu sagen, dass das 2'-OH nicht an der Bindung beteiligt ist.
Ich interessiere mich für beides – wenn wir es im Labor machen können, ist es technisch machbar und das wäre interessant. Aber wenn es möglich ist, könnte es überhaupt auf natürliche Weise passieren? Und Sie haben natürlich Recht, das 2'-OH ist an der Bindung beteiligt, ich versuchte zu sagen, dass es nicht zur Bildung einer neuen Bindung verwendet wird (also nicht direkt beteiligt ist).

Antworten (2)

Dies ist ziemlich einfach, wenn Sie Oligonukleotide chemisch und nicht enzymatisch synthetisieren. Dies erfolgt typischerweise unter Verwendung der Phosphoramidit-Chemie und ermöglicht die Synthese von chimären RNA/DNA-Oligos. Sie können sogar modifizierte Nukleoside wie 2'-O-Me oder LNA einbauen.

Dies geschieht typischerweise, wenn Sie die Eigenschaften eines Oligos verändern wollen, zB wenn Sie es gegen den Abbau durch Enzyme resistent machen wollen.

Das plus das Papier, das Alan Boyd unten gepostet hat, hat meine Frage beantwortet. Danke schön!

Alle DNA-Polymerasen verwenden während der DNA-Replikation einen RNA-Primer – sie können ein DNA-Molekül nicht de novo beginnen . Bevor der Primer entfernt wird, ist der neu synthetisierte Strang ein RNA-DNA-Hybrid. Das erste in die neue DNA einzubauende Desoxynukleotid wird an das 3'-OH einer RNA angefügt.

Zählt das?

Später hinzugefügt : Dies sieht aus wie ein Ort, an dem Sie mit dem Lesen beginnen können

Es zählt. Aber ich frage mich immer noch, ob es möglich ist, ein Desoxynukleotid in der Mitte eines RNA-Strangs zu finden. BTW: Danke für die Korrektur der Frage :-)
Kann ein dNTP in einen RNA-Strang eingebaut werden?
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