Ich frage mich, was der Unterschied in den hier gehosteten Daten ist:
Außerdem (Nebenbemerkung) wäre es interessant zu bemerken, was der Unterschied zwischen ftp-traceund einfach ftpist. Aber es gibt wahrscheinlich über 1 TB an Daten in /genomes, und ich nehme an, etwas von "tausend Genome" ist in /1000genomes, aber ich bin mir nicht sicher, welche Daten genau. Würde gerne wissen, was diese beiden Ordner sind und wo sich die 1000genomes-Daten genau befinden. Es sieht so aus, als hätte /1000genomes/ftp/data/ "Sequenzdaten", aber ich bin mir nicht sicher, wie das mit der /genomesListe der Artnamen verglichen wird (und ich bin mir auch nicht sicher, was "Sequenzdaten" genau beinhalten).
Der einfachste Unterschied ist der Maßstab und die Reichweite. Das Ziel des 1000-Genom-Projekts war die Bereitstellung einer umfassenden Bibliothek menschlicher genetischer Variationen. DNA von Personen aus verschiedenen ethnischen Gruppen, geografische Standorte wurden sequenziert und die Ergebnisse der Studie wurden hier veröffentlicht .
Genome von NCBI stammen von verschiedenen Organismen, und die Anzahl der sequenzierten Individuen unterscheidet sich zwischen den Arten (einschließlich Menschen). Diese Datenbank wächst ständig. Eine ausführliche Beschreibung finden Sie hier .
Tatsächlich sind diese beiden Dinge sehr unterschiedlich und ich würde sagen, ziemlich gegensätzlich.
NCBI-Genome sind eine Sammlung von Informationen über Genome verschiedener Arten, einschließlich Sequenzen, Karten, Chromosomen, Assemblierungen und Anmerkungen. Im Grunde ist es ein Katalog von Referenzgenomen.
1KG ist ein Katalog humangenetischer Variationen aus einer genomweiten Assoziationsstudie.