Was ist strukturelle RNA?

In der Genbank ( ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_refseq/Fungi/Saccharomyces_cerevisiae_uid128/ ) gibt es ein Archiv .frn (Nukleotidsequenzen von strukturellen RNAs im Fasta-Format), und ich möchte es wissen die Unterschiede zwischen strukturellen RNAs und Genen. Sind die Nukleotidsequenzen von strukturellen RNAs eine codierende Region?

Mein Ziel ist es, die codierende Region von der nicht codierenden Region eines bestimmten vollständigen Genoms zu trennen.

Ich bin Physiker, also entschuldige ich mich, wenn meine Frage ziemlich einfach ist.

@David Ich denke, "strukturelle RNA" ist kein Standardbegriff. Ich erwarte nicht einmal, dass Biologen sicher sind, was das bedeuten könnte.
@WYSIWYG — Die Untersuchung einer Datei mit der Erweiterung .fm gibt Namen für einige dieser strukturellen RNAs, wie z. B. Pro tRNA, 15S ribosomale RNA. Ich nehme an, der Poster hat das gelesen. Ich hätte erwartet, dass er versuchen würde, herauszufinden, was eine tRNA und eine ribosomale RNA eigentlich sind. Wenn er nicht bereit ist, sich die Mühe zu machen, etwas über Molekularbiologie zu lesen, verschwendet er seine (und unsere) Zeit.

Antworten (1)

Ganz kurz: Ein Gen ist eine DNA- oder RNA-Sequenz, die erblich ist und eine biologische Funktion hat. In dem von Ihnen geposteten Genom von Saccharomyces cerevisiae ist jedes Gen eine DNA-Sequenz. Die Funktion der meisten Gene besteht darin, Boten-RNA (mRNA) zu transkribieren , die dann in ein Protein übersetzt wird . "Codierende" DNA bezieht sich auf DNA, deren Sequenz schließlich in Protein übersetzt wird

Strukturelle RNAs werden von Genen codiert, aber nicht in Protein translatiert und sind daher keine codierenden Regionen. Sie bestehen aus RNA, funktionieren aber eher wie Proteine. Wenn sie wie Enzyme Reaktionen ermöglichen, werden sie als Ribozyme bezeichnet . Die bekanntesten sind die Ribosomen , die ein wesentlicher Bestandteil der Proteinbiosynthese sind. Andere bilden spezielle Strukturen, die Molekülen helfen, sich gegenseitig zu erkennen. tRNAs werden benötigt, damit das Ribosom die richtigen Aminosäuren erkennt.

Wie David sagte, ist dies eine sehr grundlegende Molekularbiologie, und die Genregulation/Expression in Eukaryoten kann ziemlich komplex werden . Die Wikipedia-Artikel bieten eine gute Einführung und das Berg-Biochemiebuch, das er verlinkt hat, ist eine ausgezeichnete weiterführende Lektüre. Wenn Sie mehr über Hefegenome erfahren möchten, besuchen Sie https://www.yeastgenome.org/ . Es liefert eine Menge Informationen über die Menge an codierenden/nicht codierenden Regionen und deren Funktion. Es gibt auch einen grafischen Genombrowser, in dem Sie jede Region im Detail anzeigen und mit Ihren eigenen Ergebnissen vergleichen können.

Kodierende DNA bezieht sich speziell auf Regionen, die in Protein übersetzt werden. Nicht-kodierende RNA wie tRNA oder rRNA sind per Definition nicht Teil der kodierenden Regionen.
Ich habe die Bearbeitung genehmigt, bin mir aber nicht sicher, ob es in Ordnung ist, das Schlüsselkonzept der Antwort eines anderen Benutzers zu ändern.
Molekularbiologische Terminologien sind in der Regel schwierig und manchmal ist die Verwendung von Person zu Person unterschiedlich.
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