Ich studiere Informatik im Grundstudium und habe ein Projekt über Bioinformatik. Auf diese Weise muss ich das Vertrauen in die Vorhersage (oder Assoziation, ich bin mir nicht sicher, welche Terminologie korrekt ist) von miRNA-Krankheitsbeziehungen finden. Lassen Sie mich meine Frage anhand eines Beispiels verdeutlichen. Zum Beispiel wird in einer der Bioinformatik-bezogenen Datenbanken (HMDD) gesagt, dass miRNA X mit Krankheit Y verwandt ist. Ich möchte herausfinden, was das Vertrauen ist. Ich meine, Sie sind sich 100% sicher, was eine solche Beziehung angeht? Kennen Sie eine Datenbank für diesen Zweck? In HMDD kann ich nur miRNA-Krankheitsnamen-Paare finden, es gibt keine Statistiken.
Sie können damit beginnen, zu untersuchen, wie eine miRNA die Funktion eines Gens reguliert. es bindet im Wesentlichen an die 3'UTR und 5'UTR einer mRNA und schränkt ihre Translation ein. Es wird Gene geben, die mit der Krankheit Ihres Interesses assoziiert sind, finden Sie heraus, welche miRNAs mit diesen Genen verwandt sind. Sie können Microarray-Daten verwenden, um die hochregulierten Gene herauszufinden. Target Scan Human, miRDB, sind verschiedene Datenbanken zum Abrufen der mit den Genen verbundenen miRNAs. Das Konfidenzniveau, um die Assoziation bestimmter miRNAs mit der Krankheit herauszufinden, kann niemals 100 % betragen. aber eine Beziehung kann hergestellt werden, indem einfach die Komplementarität zwischen der miRNA und der während des Krankheitszustands exprimierten mRNA betrachtet wird.
Nandor Poka
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