Anzahl der Introns in einem Genom

Menschen haben ungefähr 21000 Gene, aber sie stellen wahrscheinlich mehr Proteine ​​her. Dies wurde durch viele Mechanismen wie alternatives RNA-Spleißen erklärt.

Meine Frage ist: Wenn das, was wir als "Introns" und "Exons" bezeichnen, so stark variiert, wie wird dann die Anzahl der in einem Genom vorhandenen Introns bestimmt?

Was meinst du? Was wir „Introns“ und „Exons“ nennen , ist eigentlich ziemlich gut definiert. Es ist das Konzept der "Gene", das Probleme verursacht. Das Zählen von Introns ist relativ einfach (solange Sie eine genaue Zählung der Gene haben). Es ist keine sehr nützliche Übung, aber es ist nicht schwer.
@terdon Ich wollte nicht sagen, dass unser Konzept dessen, was wir als Intron und Exon sagen, unterschiedlich ist. Ich meinte, dass die Sequenzen, die wir als Introns und Exons bezeichnen, für jedes unterschiedliche Protein derselben Prä-m-RNA variieren würden.
Ah, ich verstehe, also alles, was es zu einer reifen mRNA schaffen kann, ist per Definition ein Exon. Alles, was dies nicht tut, ist ein Intron. Also ja, derselbe Abschnitt genomischer Nukleotide kann tatsächlich beide in verschiedenen mRNAs vorkommen.

Antworten (1)

Ja, die individuelle Anzahl von Exons/Introns wird in einem Transkript variieren, aber Sie können einfach alle möglichen Exons eines Gens zählen. Nehmen wir zum Beispiel an, Sie haben ein alternatives Exon in diesen beiden Isoformen. Die XX sind Exons

XX---XX---XX---XX

XX--------XX---XX

Wir würden sagen, dieses Gen hat 4 Exons und 3 Introns, obwohl eine Isoform nur 3 Exons hat. Es ist das Transkript, das in der Anzahl der Exons variiert, das Gen bleibt konstant.

Heres ein etwas komplexeres Beispiel. Sich gegenseitig ausschließende Exons

XX---XX--------XX

XX--------XX---XX

Wir würden immer noch sagen, dass es vier Exons hat. Stellen Sie sich vor, dass jedes Exon jeder Isoform enthalten ist, und so erhalten Sie die Anzahl der Exons im Gen. Stellen Sie sich also für das obige Beispiel einfach vor, dass beide sich gegenseitig ausschließenden Exons enthalten sind

XX---XX---XX---XX

Laut dieser alten Arbeit gibt es 8,8 Exons pro Gen (7,8 Introns). Ihre Genzahl ist hoch, weil sie älter ist, aber sie schätzen, dass es 207.344 Introns im menschlichen Genom gibt.

Introns sind nicht immer "Exons - 1", Sie können beispielsweise gespleißte UTRs mit einem führenden Intron oder einem nachgestellten in der 3'-UTR haben.
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