Ich habe Kaposi-Sarkom gelesen und Robbins Pathology sagt:
... viele Merkmale deuten darauf hin, dass KS trotz des ominösen Namens kein bösartiger Tumor ist ... Spindelzellen in vielen KS-Läsionen sind polyklonal oder oligoklonal
Dies wird auch bei multinodulärem Kropf beobachtet, wo die Läsionen polyklonal sind, aber einige monoklonale Knötchen gefunden werden.
Meine Frage ist, wie werden diese ermittelt? Durch die Sequenzierung, ist es nicht so, dass es im Krebswachstum unzählige Mutationen gibt, wie kann man abbilden, ob die vorhandenen Mutationen auf monoklonale Expansion oder polyklonale Expansion zurückzuführen sind? Hätten in nicht krebsartigen Wucherungen nicht alle Zellen denselben Genotyp?
Die polyklonale und monoklonale Expansion in B-Zellen ist mir klar, da eine polyklonale Linie unterschiedliche vdj-Rekomben aufweisen würde, während monoklonale dieselben aufweisen würden. Entscheidet sich auch hier die Genomsequenzierung oder die Ig-Sequenz?
Es gibt einige Möglichkeiten, die Klonalität zu bestimmen. Sequenzierungsbasierte Methoden sind wahrscheinlich die billigsten, angesichts der derzeitigen Kosten für entweder die Sequenzierung oder den noch billigeren PCR-basierten Klonalitätsassay. Andere Methoden können unter anderem die Histomorphologie, die Suche nach bekannten Chromosomenaberrationen und/oder die Immunphänotypisierung umfassen. Hier ist ein schöner Überblick über einige der Klonalitätstestmethoden.
Sequenzierung und PCR wären die eindeutigsten Methoden zur Bestimmung der Klonalität eines Tumors, da sie Informationen über die exakten Sequenzen von Zellsätzen liefern.
Die Exomsequenzierung wäre ein guter Weg, um die Klonalität in einer großen Gruppe von Zellen zu bestimmen, bei denen Sie nicht unbedingt a priori wissen, wonach Sie suchen müssen. PCR ist viel billiger und fokussierter und könnte eine bessere Wahl sein, wenn Sie ein spezifisches Ziel zum Sequenzieren haben, wie z. B. hochpolymorphe Gene wie einige Androgenrezeptoren und die Gene, die an der VDJ-Rekombination beteiligt sind.