Ich lese dieses Papier https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC392475/ und kann nicht herausfinden, warum ein bestimmtes Immunserum nicht auf dasselbe virale Protein wirkte, sondern auf ein anderes Stämme.
Das Serum wurde aus tumortragenden Tieren extrahiert, die mit dem 'SR'-Stamm des Rous-Sarkom-Virus infiziert waren, und wurde später verwendet, um das virale Protein p60-src aus virusinfizierten Zellen auszufällen. Die fraglichen Zellen waren entweder mit SR oder anderen eng verwandten Stämmen infiziert worden, alle Stämme exprimieren das gleiche Protein. Aber das Antiserum extrahierte nur das p60-src des SR-Stammes und nicht das gleiche Protein aus anderen Stämmen. Ich dachte, es könnte daran liegen, dass das Serum zufällig auf ein für den SR-Stamm spezifisches Epitop abzielte, sodass Sie eine starke Proliferation von B-Zellen erhalten, die komplementär zu diesem Epitop sind, wodurch der Nachweis anderer Epitope überschattet wird. Aber 1. Ich glaube, das Serum wurde mehreren Kaninchen entnommen, und das hätten sicher nicht alle so gemacht. und 2. In einem späteren Artikel, den ich gelesen habe, heißt es, dass p60-src über SR-, Pr-, Br-Stamm usw. zu 98% gleich ist, sodass es unwahrscheinlich ist, dass es sich auf ein SR-spezifisches Bit eingeklinkt hat. Und dennoch stellen die Autoren fest, dass aufgrund von Ähnlichkeiten zwischen SRC-Genen "... ähnliche Genprodukte wahrscheinlich in Zellen vorhanden sind, die durch andere ASV-Stämme transformiert wurden, aber sie werden wegen fehlender Kreuzreaktion mit den derzeit verfügbaren Antiseren nicht nachgewiesen. "
Meine Frage ist also, was diese fehlende Kreuzreaktion verursacht? Entschuldigung, wenn die Antwort sehr offensichtlich ist, ich bin neu in dem Thema und habe derzeit sehr wenig Wissen über experimentelle Methoden. Vielen Dank im Voraus für alle Erkenntnisse oder Korrekturen der Schlussfolgerungen, die ich bisher gezogen habe, da sie möglicherweise auch ungenau sind.
Hinweis: Danke Mods, dass ich die Frage bearbeiten durfte, um die Privatsphäre zu verbessern.
Wie Sie bemerken, sind die Virusstämme nicht identisch; Aus Ihrer Frage geht die tatsächliche Menge und Position der Aminosäureunterschiede zwischen ihnen nicht hervor, aber es ist nicht überraschend, dass sogar ein Teil des Proteins ein immundominantes Epitop aufweist und somit die reproduzierbare Stammspezifität jedes produzierten Immunserums vorantreibt.
Denken Sie daran, dass die Kaninchen oder andere Tiere, die zur Herstellung von Antikörpern verwendet werden, typischerweise zumindest teilweise Inzuchtstämme sind, die für den Laborgebrauch gezüchtet wurden, und daher wahrscheinlich weniger genetische Vielfalt unter den Individuen aufweisen, als Sie sonst erwarten würden.
Eine andere Veröffentlichung aus dieser Zeit berichtet, dass verschiedene Immunseren, die von verwandten Virusstämmen erzeugt und in verschiedenen Tieren produziert wurden, von der Immunpräzipitation des src-Virusproteins in keinem der getesteten Virusstämme bis zur Immunpräzipitation des Proteins in allen getesteten Virusstämmen reichten: „Nachweis der Virales Sarkom-Genprodukt in Zellen, die mit verschiedenen Stämmen des Vogelsarkomvirus infiziert sind ..." Brugge et al. (1979) Journal of Virology, Bd. 29, Nr. 3, S. 1196–1203
AliceD
Chris