Wenn man DNA-Stränge synthetisiert und beginnt, sie zu „verbinden“, wie schnell wird daraus eine Helix?
In dieser Antwort sagt der Kanadier
Die helikale Struktur ist stabiler als die "gerade" Form (aufgrund von Basenstapelwechselwirkungen) und bildet sich daher spontan.
Da fällt mir folgendes Szenario ein: Nehmen wir an, man konstruiert zwei DNA-Stränge aus Desoxyribonukleotiden. Dann beginnt man, sie mit Wasserstoffbrückenbindungen zu verbinden. Bevor die Wasserstoffbrückenbindungen hinzugefügt werden, sind die beiden Stränge meines Wissens gerade und nicht spiralförmig (wenn dies falsch ist, korrigieren Sie mich bitte), sodass sie irgendwann, wenn die beiden Stränge verbunden sind, "spontan" spiralförmig werden würden.
Die Frage ist dann, an welcher Stelle. Nach einer "Verbindung"? Zwei? Alle Verbindungen, die notwendig sind, um das DNA-Stück zu vervollständigen?
Im Allgemeinen ist eine einzelsträngige Nukleinsäure in Abwesenheit einer anderen Sekundärstruktur helikal. Die Basenstapelung, die die Helixbildung antreibt, tritt zwischen benachbarten Basen im selben Strang auf. Beachten Sie jedoch, dass solche Strukturen dynamisch und von Eigenschaften wie Temperatur und Salzkonzentration abhängig sind. Ein Beispiel für eine einzelsträngige RNA-Helix sehen Sie in der folgenden Kristallstruktur ( 1MHK ):
Beachten Sie, dass die blaue Helix am unteren Rand des Bildes tatsächlich ein Duplex im Kristall ist.
Kanadier
Kanadier
David