An welchem ​​Punkt werden DNA-Stränge, wenn sie verbunden sind, zu einer Helix?

Wenn man DNA-Stränge synthetisiert und beginnt, sie zu „verbinden“, wie schnell wird daraus eine Helix?

In dieser Antwort sagt der Kanadier

Die helikale Struktur ist stabiler als die "gerade" Form (aufgrund von Basenstapelwechselwirkungen) und bildet sich daher spontan.

Da fällt mir folgendes Szenario ein: Nehmen wir an, man konstruiert zwei DNA-Stränge aus Desoxyribonukleotiden. Dann beginnt man, sie mit Wasserstoffbrückenbindungen zu verbinden. Bevor die Wasserstoffbrückenbindungen hinzugefügt werden, sind die beiden Stränge meines Wissens gerade und nicht spiralförmig (wenn dies falsch ist, korrigieren Sie mich bitte), sodass sie irgendwann, wenn die beiden Stränge verbunden sind, "spontan" spiralförmig werden würden.

Die Frage ist dann, an welcher Stelle. Nach einer "Verbindung"? Zwei? Alle Verbindungen, die notwendig sind, um das DNA-Stück zu vervollständigen?

Ja, im Allgemeinen ist das richtig.
Ich werde es bald tun, froh, dass es geholfen hat.
@canadianer hat Ihre Frage beantwortet, aber Sie sollten sich darüber im Klaren sein, dass sie für Wissenschaftler aufgrund ihrer hypothetischen Natur und experimentellen Unprüfbarkeit und der Tatsache, dass sie kein Problem in den biologischen oder physikalischen Wissenschaften anspricht, von geringem Interesse ist. DNA wird durch Enzyme polymerisiert, und wir verstehen etwas darüber, was bei diesen Reaktionen vor sich geht. Wir wissen auch, dass es nicht die Art von Faltungsproblem gibt, die für Proteine ​​existiert. Wir können einer bereits bestehenden Helix (bei der Phosphodiesterbindungen hergestellt werden) keine Desoxynukleotide in der von Ihnen vorgeschlagenen Weise ohne Enzyme, Matrize und Primer hinzufügen.

Antworten (1)

Im Allgemeinen ist eine einzelsträngige Nukleinsäure in Abwesenheit einer anderen Sekundärstruktur helikal. Die Basenstapelung, die die Helixbildung antreibt, tritt zwischen benachbarten Basen im selben Strang auf. Beachten Sie jedoch, dass solche Strukturen dynamisch und von Eigenschaften wie Temperatur und Salzkonzentration abhängig sind. Ein Beispiel für eine einzelsträngige RNA-Helix sehen Sie in der folgenden Kristallstruktur ( 1MHK ):

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Beachten Sie, dass die blaue Helix am unteren Rand des Bildes tatsächlich ein Duplex im Kristall ist.