Horizontaler Gentransfer

Ich verstehe die verschiedenen Möglichkeiten, wie Bakterien einen horizontalen Gentransfer durchlaufen können (Transformation, Transduktion (Phagen), Konjugation (Plasmide)).

Gibt es eine experimentelle Methode, um zu sagen, wie ein bestimmtes Gen in den Wirt gelangt ist (während der Evolution)? Wenn zum Beispiel ein Gen A von Art Y in Wirt X gelangt ist, ist es dann möglich zu wissen, wie Gen A übertragen wurde?

Ich verstehe deine Frage nicht. Was genau versuchst du zu bestimmen/unterscheiden? Würde es Ihnen etwas ausmachen, Ihre Frage in einer klareren Form neu zu formulieren?
@Soph - Ich habe Ihre Frage bearbeitet, um das Schließen der Frage zu vermeiden. Sie können meine Bearbeitung rückgängig machen, wenn Sie möchten.
Sehr interessante Frage. Meine wilde Vermutung ist vielleicht ja, wenn ich mir die DNA-Regionen um das Gen anschaue. Sie würden wahrscheinlich einige Basenpaare aus dem Vektor erhalten, aber ich bin mir nicht sicher, wie viele und ob dies ausreichen würde, um dies auf ein Plasmid oder einen Phagen zurückzuführen. Werde das nachschauen.
@cagliari2005 - Das habe ich mir auch gedacht. Die Integration in das Wirtsgenom erfordert Homologie, da höchstwahrscheinlich einige verbleibende eytra-Sequenzen um das integrierte Gen herum vorhanden sind.

Antworten (1)

Wenn Sie sich evolutionäre Zeitskalen ansehen, dann ist die einzige verfügbare Informationsquelle die Genomsequenz des Zielorganismus. Zumindest einige der von Ihnen erwähnten Methoden des horizontalen Gentransfers hinterlassen eine unverwechselbare Signatur im Genom. Beispielsweise lassen sich Retrovirus-Partikel, die in das menschliche Genom eingebaut wurden, leicht anhand ihrer lokalen DNA-Sequenz identifizieren .

In Bezug auf ein Experiment würden Sie also Ihr spezifisches interessierendes Gen sowie die umgebende lokale Sequenz (z. B. 10.000 Basenpaare stromabwärts und stromaufwärts Ihres Gens) sequenzieren. Zumindest in einigen Fällen könnte man mit Sicherheit sagen „dieses Gen entstand durch retrovirale Inkorporation“, während es in anderen mehrdeutig wäre.

Referenzen:
Belshaw, R. et al. Langfristige Reinfektion des menschlichen Genoms durch endogene Retroviren. PNAS (2004)

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