Können Bakterien freie DNA in ihre Umgebung abgeben?

Natürliche Transformation AKA natürliche Kompetenz beinhaltet die Aufnahme von DNA in ein kompetentes Bakterium (für horizontalen Gentransfer oder als Nahrungsquelle). Meine Frage ist, woher diese extrazelluläre DNA kommen kann. Typischerweise stammt diese "freie" DNA aus lysierten Bakterienzellen. Gibt es Fälle, in denen DNA ohne Lyse freigesetzt wird, die andere Bakterien durch natürliche Transformation aufnehmen können?

Hinweis: Ich interessiere mich nicht für bakterielle Konjugation , weil ich speziell an extrazellulärer DNA interessiert bin, die von kompetenten Bakterien internalisiert werden kann.

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Natürliche Transformation

Der Prozess der natürlichen Transformation ( Lorenz und Wackernagel 1994 ) hat eine sehr große Bedeutung in der Evolution von Prokaryoten. Definition zitiert aus ( Stewart und Carlson 1986 )

Natürliche Transformation ist Teil der normalen Physiologie der Zelle. Es ist die einzige Form des bakteriellen genetischen Austauschs, deren Funktionen auf dem Chromosom codiert sind, und Kompetenz ist eine vererbbare Eigenschaft, die einem Selektionsdruck unterliegt.

Dies ähnelt fast unserer täglichen künstlichen Transformation . Sie brauchen etwas Chemisches wie C a C l 2 zu zellpermiabalisierten, einigen Chelatbildnern wie EDTA und DNA-Material. Sie können sich vorstellen, dass natürlich vorkommende Zellen solchen Bedingungen ausgesetzt sind, wie z. B. einem Temperaturabfall in Gegenwart bestimmter Chemikalien und Proteine.

Dieses Konzept, dass eine Zelle DNA externalisiert und eine andere DNA internalisiert, wurde stärker, als Forscher freie DNA in Kulturmedien beobachteten ( Catlin 1959 , Sinha und Iyer 1971 ).

Die Erstellung von eDNA

Die Freisetzung von eDNA (extrazelluläre DNA) kann durch spontane Ausscheidung oder autolytische Wirkung erfolgen.

Es gibt bekannte Mechanismen für die Freisetzung von eDNA wie die Bildung von Bläschen ( Dorward und Garon 1990 ). Diese extrazelluläre DNA-Produktion wird durch viele physiochemische Faktoren beeinflusst als biotische ( Paul und David 1989 ). Es gibt viele detaillierte Berichte, die zeigen, dass solche DNA ohne jegliche Zellschädigung durch die Zellwand geleitet werden kann ( Hara und Ueda 1981 ). Die Halbwertszeit solcher eDNA in verschiedenen Umgebungen ist in der folgenden Tabelle von ( Lorenz und Wackernagel 1994 ) angegeben.

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Jetzt gibt es sogar noch mehr neue Wege der Produktion von extrazellulärer DNA, wie in Neisseria gonorrhoeae die Sekretion von chromosomaler DNA über ein neues Typ-IV-Sekretionssystem erfolgt ( Hamilton et al. 2005 ). Nicht nur Experimente, mathematische Modelle zeigen auch die neuartige Rolle eines solchen Prozesses bei der Selektion auf Genebene ( Draghi und Turner 2006 ). Ich habe die Aufnahme dieser DNA nicht angesprochen, die selbst viel Literatur und einzigartige Mechanismen wie diesen enthält .

Das ist genau das, wonach ich gesucht habe. Darf ich auch hinzufügen, dass sie in der Rezension von Chen & Dubnau aus dem Jahr 2004 diskutieren, dass H. pylori einen Mechanismus hat, der mit dem Typ-IV-Sekretionssystem verwandt ist, um Makromoleküle wie DNA zu exportieren.
In der Tat. Dieser Aufsatz (Lorenz und Wackernagel 1994) ist sehr schön. Da bekommt man allerhand Referenzen. Überraschenderweise habe ich dazu (nach 2000) kaum neuere Arbeiten gefunden. Wurde die Terminologie geändert oder so?
Als ich den Artikel von Lorenz & Wackernagel zum ersten Mal „las“ (es ist ein klobiges Papier!), dachte ich, dass es hauptsächlich um die Aufnahmemaschinerie geht, was mich damals interessierte. Beim erneuten Lesen hat es einen ganzen Abschnitt über Ausscheidung! Was neuere Arbeiten betrifft, so gibt es den Burton & Dubnau Review aus dem Jahr 2010, der viele der neueren Studien zusammenfasst. Besonders sind mir die FtsK/SpoIIIE-Proteine ​​aufgefallen. Dies sind jedoch ziemlich andere Systeme als alles, was ich studiere.

Gute Frage, das Einzige, was ich hinzufügen kann, ist, dass in Biofilmen die DNA zwar durch Lyse freigesetzt wird, die Lyse jedoch mithilfe von Quorum Sensing kontrolliert wird und bestimmte Subpopulationen beeinflusst (Okshevsky & Meyer, 2013) .

Das ist bizarr! Sehr interessant, hilft aber leider nicht bei der Beantwortung meiner Frage. Es mag einige Informationen in der Zeitung geben, aber leider ist es hinter einer Paywall!
@GoodGravy Eine Kopie des Papiers finden Sie hier .