Wie kann E. coli die Expression von C. elegans beeinflussen?

Plasmide können auf E. coli übertragen werden . Diese transformierten E. coli können an C. elegans gefüttert werden , um seine Genexpression durch RNAi zum Schweigen zu bringen.

Wie kann E.coli RNAi an C. elegans abgeben ? Selbst wenn wir davon ausgehen, dass E. coli als intrazelluläre Bakterien in Zellen von C. elegans eindringen könnte , ist es schwer vorstellbar, dass RNAi E. coli direkt verlässt und in die Zellen von C. elegan eindringt ? Normalerweise werden keine Zellen oder Bakterien RNA oder genomisches Material außerhalb ihrer Zellen freisetzen?

@Chris Gibt es eine Möglichkeit, diese Frage mit dieser zusammenzuführen biology.stackexchange.com/questions/38586/… ? Obwohl es sich um doppelte Fragen handelt, stellt diese die Frage klarer und präziser?
"Normalerweise werden keine Zellen oder Bakterien RNA oder genomisches Material außerhalb ihrer Zellen freisetzen?" Horizontaler Gentransfer in Bakterien. Menschliches Immunsystem Neutrophile und neutrophile extrazelluläre Fallen...
Dieser Beitrag enthält einige zusätzliche Informationen darüber, wie dsRNA von C. elegans aufgenommen wird

Antworten (1)

Ja, so bizarr es auch scheinen mag, genau das passiert. E. coli exprimiert eine doppelsträngige RNA-Haarnadel (unter der Regulierung eines induzierbaren Promotors), und die RNA enthält eine Sequenz, die von einem C. elegans -Gen abgeleitet ist. Wenn die Würmer die Bakterien fressen, zermahlen sie sie in ihrem Rachen und setzen den Zellinhalt (einschließlich der induzierten RNA) in den Darm der Würmer frei. Die Darmzellen sind in der Lage, die dsRNA aufzunehmen und auch zu anderen Zellen zu transportieren. Der RNAi-Weg verarbeitet die inhibitorischen RNAs, um das Zielgen herunterzuregulieren.

Das ist jetzt überraschend ! +1. Ich habe versucht, die Frage zu bearbeiten. Könntest du prüfen, ob es in Ordnung ist? Es ist nicht wirklich meine Expertise.
Sie können auch eine Anmerkung zu RNA-Transportern in C.elegans hinzufügen ( Sid1/2 ). Obwohl ich mir nicht sicher bin, vermute ich, dass C. elegans (oder vielleicht verwandte Organismen) diese Transporter stärker exprimiert als andere Organismen, die wir kennen.
@WYSIWYG Ilan und Sie hatten eine ähnliche Antwort auf eine Frage von mir zu c.elegans gegeben. Ich denke, meine Frage könnte mit dieser zusammengeführt werden. (Kann den Link nicht bereitstellen .... über die App)
Zunächst einmal können Darmzellen die dsRNA aufnehmen, aber wir sprechen bei C.elegans von den ganzen Körperzellen! Wenn wir RNAi von EGFP umwandeln, wird es das EGFP des gesamten Körpers zum Schweigen bringen ... oder nicht? Zweitens wird RNAi von E.coli oder C.elegans hergestellt? Ich spreche nicht von dsRNA. Wenn RNAi von C.elegans hergestellt wird, bedeutet dies, dass C.elegans die von E.coli freigesetzte dsRNA absorbieren muss. Soweit ich weiß, ist dsRNA möglicherweise größer als Proteine ​​... ist es möglich, die dsRNA direkt zu absorbieren? Und auch, zurück zur ersten Frage, wie kann sich dsRNA im ganzen Körper von C.elegans ausbreiten, um das Gen der meisten Zellen im ganzen Körper zum Schweigen zu bringen?
@RogerL. Sie verwechseln den Begriff RNAi, bei dem es sich um einen biologischen Regulationsmechanismus handelt, der mRNA abbaut, mit kleiner dsRNA, die den RNAi-Weg auslösen kann. Die Bakterien synthetisieren die dsRNA und diese wird freigesetzt, wenn die Bakterien sterben. Die C. elegans -Zellen absorbieren oder bauen diese bakteriell synthetisierten dsRNAs ein UND enthalten Transporter, die die dsRNA zwischen benachbarten Zellen verteilen. Also ja, EGFP, das in Körperwandmuskeln exprimiert wird, wird durch im Darm aufgenommene dsRNA zum Schweigen gebracht. Der RNAi-Komplex kommt in allen Wurmzellen vor.
Zwei Wurmgene, die andere Wurmgene über diesen Signalweg regulieren, sind let-2 und lin-4 . Sie codieren keine Proteine; sie codieren kleine interferierende RNAs, die an reife mRNAs von anderen Genen binden – proteincodierende Gene. Sobald das Lin-4- Transkript an sein komplementäres Ziel bindet, löst diese dsRNA den RNAi-Abbauweg aus. Sie können auch dsRNA in Würmer injizieren (aber es ist arbeitsintensiv), oder Sie können dsRNA in vitro synthetisieren und die Tiere einfach darin einweichen, um den gleichen Effekt zu erzielen, als würden sie künstlich hergestellte Bakterien füttern.