Funktionsweise von EDTA

Ich weiß, dass EDTA Metallionen chelatisiert. Es schwächt die Bakterienzellwand und inaktiviert die DNasen.

Was ist der Grund, warum es das tun kann? Ich schätze, es kann DNasen inaktivieren, indem es die Mikroumgebung verändert. Was genau passiert?

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Die Lipopolysaccharidschicht der gramnegativen Bakterienzellwand wird durch zweiwertige Kationen stabilisiert. Die meisten Rezepte zum Aufbrechen von E. coli- Zellen enthalten aus diesem Grund Tris-EDTA. Ich scheine das nur zu wissen , also im Moment keine Referenz.

Alle Nukleasen benötigen Mg 2+ , weshalb EDTA im Stopppuffer enthalten ist, der den Restriktionsverdauungen zugesetzt wird. Die Verschleppung von EDTA in DNA-Pellets kann manchmal Verdaus hemmen.

Viele Enzyme benötigen ein Metallion in ihrem aktiven Zentrum (es ist tatsächlich das Metallion, das an der katalysierten Reaktion teilnimmt). Dies sind Mangan, Magnesium, Kupfer und so weiter. Für DNAsen ist das Metall im aktiven Zentrum Magnesium und EDTA chelatiert diese Ionen einfach, macht sie für das Enzym unverfügbar und behindert somit das Enzym an der Arbeit.

Chelatbildung ist der Prozess, bei dem Metallionen in Molekülen koordiniert werden und koordinative Bindungen zum Chelatbildner bilden. EDTA sieht so aus:

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Die 3D-Struktur beim Chelatisieren von Metallionen wie folgt:

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Sie können sehen, dass das Metallion schön zwischen den negativ geladenen Sauerstoffatomen und den Stickstoffatomen angeordnet ist. Diese Komplexe sind ziemlich stabil und die Metallionen entweichen nicht.

Können Sie mir auch sagen, warum es die Bakterienzellwand zerstört?
Wer behauptet das, hast du dazu ein Protokoll (damit ich nachsehen kann)? Alle Puffer, die ich für diesen Zweck kenne, enthalten auch Detergenzien, die tatsächlich Zellwand und Membranen aufbrechen. EDTA hat die Funktion, Enzyme zu hemmen.
Ich habe es in meinem Lehrbuch gelesen.
Man könnte hinzufügen, dass „Chelatbildung“ bedeutet: EDTA hat zwei Amine und vier Carbocylsäuren, die eine kompakte Hülle um Metallionen bilden, sie binden so fest, dass sie nirgendwo anders binden können.
Guter Punkt, ich habe dies der Antwort hinzugefügt.
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