Warum werden prokaryotische Promotorsequenzen von 5' nach 3' geschrieben, wenn die Transkription von 3' nach 5' erfolgt?

Es scheint, dass die Promotorregionen von der 5'- zur 3'-Richtung geschrieben sind. Meine Vorlesungsnotizen geben beispielsweise die Sequenzen der -35- und -10-Promotorregionen wie folgt an:

Förderregion

Wikipedia scheint dem in ihrem Artikel über Promoter zuzustimmen .

Die RNA-Polymerase transkribiert jedoch in der 3'- bis 5'-Richtung, da sie den Matrizenstrang in der 3'- bis 5'-Richtung liest . Warum werden in diesem Fall die Promotorregionen nicht auch in der 3'- bis 5'-Richtung geschrieben?

Das heißt, anstatt dass die -10-Sequenz ist 5'-TATAAT-3', warum stimmt sie nicht 3'-ATATTA-5'mit der Richtung der Transkription überein?

Meine intuitive Vermutung ist, dass die σ Faktor erkennt die Promotorregion in einer Richtung von 5' nach 3'. Aber ich kann keine Informationen finden, die diese Vermutung stützen. Außerdem, wenn dies wahr ist, wie hätte es (experimentell) bestimmt werden können? Was auch immer die Antwort ist, gilt sie auch für die Transkription in Eukaryoten?

Aufleuchten. Sie können nicht zulassen, dass in einer Stadt links und in der nächsten rechts gefahren wird. Es ist schon schlimm genug, wenn wir Briten auf den Kontinent gehen. Es gibt kein Geheimnis, wir lesen einfach alle Genmerkmale auf demselben Strang.
@ David Fair genug, ich nehme es als Folge der Konvention. Danke!

Antworten (1)

Die DNA-Sequenz wird gemäß Konvention beginnend an der 5'-Position geschrieben, sodass die Richtung angenommen wird, ohne explizit 5' und 3' zu schreiben. Warum ist es nicht die Template-Strangsequenz? Ich würde sagen, das ist auch eine Konvention der Einfachheit halber, weil Sie nur eine Sequenz schreiben müssen, wenn Sie Gene und regulatorische Elemente diskutieren wollen.

Warum werden prokaryotische Promotorsequenzen von 5' nach 3' geschrieben, wenn die Transkription von 3' nach 5' erfolgt?
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