Vorschläge für ein Experiment? [geschlossen]

Ich würde mich über Vorschläge für mein einjähriges AP-Biology-Projekt freuen. Ein solches Projekt würde aus einem Standardexperiment bestehen, das über einen Zeitraum von einem Jahr durchgeführt wird, also müsste es ziemlich umfangreich sein.

Ich interessiere mich für alles, was mit Zellen/DNA/Molebio zu tun hat und eine mathematische Verbindung hat. Ich >würde etwas anderes bevorzugen als bloße statistische Analysen, vielleicht so etwas wie >Differentialgleichungen.

Ich habe Zugang zu Standard-Laborgeräten für Studenten; gehe davon aus, dass ich alle notwendigen Materialien beschaffen kann und in der Lage bin, das Experiment durchzuführen. Danke für die Hilfe.

Gemäß dem Vorschlag von Shigeta unten blätterte ich durch die Links und fand Genschaltkreise interessant. Was genau ist also ein Genschaltkreis, wie werden sie modelliert und wofür werden sie verwendet?

Systembiologie.. ein Zellbioexperiment durchführen und ein mathematisches Modell für das System entwickeln. Sie können das Modell anhand der Experimente validieren.
Das musst du wirklich eingrenzen. Wir kennen Ihre Kompetenzen nicht, die Materialien, die Sie zur Verfügung haben, die Bereiche der verschiedenen Labore, zu denen Sie möglicherweise Zugang haben, es gibt keine Möglichkeit, diese Frage ohne einen viel spezifischeren Rahmen zu beantworten.
Ja, ich hätte das wahrscheinlich genauer sagen sollen; es wird bearbeitet. Ich werde mich mit Systembiologie befassen.
Auf der Ausstattungsseite werde ich noch etwas mehr brauchen. Ich betrachte die Gewebekultur als Standardarbeit im Grundstudium, weil ich im Grundstudium die meiste Zeit damit gearbeitet habe. Seit der High School mache ich auch Western. Sie erwähnen Zellen, haben Sie eine Möglichkeit, sie zu kultivieren, Sie erwähnen DNA, haben Sie Gel-Rigs und die Mittel, um DNA zu isolieren, und Molebio ist so breit gefächert, dass es nicht wirklich einschränkend ist.
Ja, ich werde Zugang zu allem haben, was Sie erwähnt haben.
Ich bin mir immer noch nicht sicher, ob dies eine gute Frage für SE ist, weil ich nicht sicher bin, ob sie beantwortet werden kann, aber ich würde in ein Vorwärtsgenetik-Experiment schauen. Sie können prädiktive und analytische Modelle erstellen und die Genetik problemlos über ein ganzes Jahr vorantreiben.
Ich schlage vor, Sie stellen die Frage zum Genschaltkreis als separate Frage. Und Sie können damit auch konkret werden – wie in „Wie würde ich ein Experiment mit solchen und so Anforderungen/Ressourcen konstruieren, um dies und so in Bezug auf Genschaltkreise zu tun?“

Antworten (1)

Das ist ein bisschen schwierig - die meisten möglichen Antworten werden Ihnen immer noch nicht gefallen, aber ich gebe Ihnen drei Vorschläge.

Es klingt, als wollten Sie etwas mit einem mathematischen Modell nehmen und versuchen, es mit Molekularbiologie zu modulieren.

Es scheint unwahrscheinlich, dass ich Ihnen wirklich ein bestimmtes Projekt nennen kann, aber es gibt vier Quellen, die ich Ihnen empfehlen möchte.

Ich denke, ich würde die weiteren einschränkenden Annahmen vorschlagen:

  1. Sie mit E. coli arbeiten möchten - es ist der einfachste und am leichtesten verfügbare Organismus, mit dem Sie arbeiten können.
  2. Sie möchten mit einem System arbeiten, das in sich in einem einzigen Plasmid enthalten ist - es ist also nur auf 2 Gene angewiesen, um zu agieren, 3 auf der Außenseite, oder Sie werden Probleme haben, alles zum Laufen zu bringen.
  3. Sie möchten ein mathematisches System, das bereits über ein gut angepasstes Modell verfügt, das Sie stören werden. Der Bau eines neuen Modells könnte ein großes erstes Projekt sein. (aber wer bin ich, Ihnen zu sagen, was zu tun ist - dies sind nur Vorschläge).

Der erste Vorschlag, den ich habe, ist Jeff Hasty von der UCSD . Er hat sich stark auf oszillierende Genschaltkreise konzentriert. Er hat einfache Systeme, die mit einem kleinen Labor reproduzierbar sein könnten, die neueste Arbeit, die einen GFP-Oszillator mit LUX kombiniert, ist ziemlich cool. Sowohl Oszillatoren als auch LUX sind unabhängig voneinander gute Systeme, mit denen man arbeiten kann. . Ich war ein Science-Fair-Richter und ich kann Ihnen sagen, dass es eine beeindruckende Menge Arbeit wäre, nur eines seiner Systeme zu reproduzieren

Ein weiteres Werk, das man sich ansehen sollte, ist Adam Arkin . Er hat sich viele Kandidaten für Schaltungskomponenten angesehen. Artikel wie „Die Jagd nach dem biologischen Transistor“ könnten Sie zum Nachdenken anregen. Dies ist ein breiteres Werk, und daher kann es eine Weile dauern, bis Sie sich ein Bild davon gemacht haben.

Drittens, wenn Ihnen das langweilig ist und Sie breiter blicken möchten, können Sie sich die iGEM-Wettbewerbe ansehen . Dies sind Projekte mit Oszillatoren und Biosynthesesystemen, denen manchmal mathematische Modelle zugeordnet sind. Der große Vorteil hier ist, dass Sie möglicherweise ein iGEM-Team gründen oder einem beitreten können und dann einige oder alle Plasmide bereits hergestellt sind - mol bio wird sehr teuer, wenn Ihnen jemand nicht einige Materialien schenkt.

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