Wie kann ich meine aktuellen DNA-Methylierungsmarkierungen sicher konservieren?

Um den aktuellen Methylierungsstatus Ihrer DNA aufzuzeichnen, können Sie die Bisulfit-Sequenzierung verwenden . Grundsätzlich nehmen Sie die Hälfte Ihrer DNA-Probe und behandeln sie mit Bisulfit, das Cytosine (C->U) desaminiert, sodass sie als T statt als C angezeigt werden. Methylierte Cytosine sind geschützt, sodass sie immer noch als C angezeigt werden. Sie führen zwei Sequenzierungsreaktionen durch , einer mit Bisulfit-behandelter und der andere mit unbehandelter DNA, sodass Sie erkennen können, wo sich die wahren Cs im Genom befinden. Siehe folgendes Diagramm:

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Beachten Sie, dass, wenn Sie dies vom Standpunkt der Langlebigkeit aus betrachten, es sehr unterschiedliche Methylierungsmuster in verschiedenen Zelltypen gibt ; Ich bin mir nicht sicher, welchen Zelltyp Sie auswählen möchten. Außerdem ist die Methylierung nicht die einzige existierende kovalente Modifikation der DNA, es gibt auch die Hydroxymethylierung , und ich wette, es gibt noch mehr, die wir noch nicht entdeckt haben. Es gibt sie sicherlich in Bakterien und Phagen ( zum Beispiel Glucosyl-hydroxymethylcytosin ). Das Schwierige daran, Dinge für die Zukunft aufzubewahren, ist, dass wir wirklich nicht das vollständige Bild dessen verstehen, was jetzt epigenetisch passiert, und daher haben wir keine Assays, um Dinge zu erkennen, von denen wir nichts wissen.

Ich glaube, dass die DNA in nativer Form so stabil sein wird, wie sie nach einer Bisulfitbehandlung sein sollte. Sie können handelsübliche Methoden zur Aufbewahrung von DNA-Proben verwenden und sicher davon ausgehen, dass sie in 20 Jahren intakt sein werden.