Beispielsweise gehört das derzeit größte bekannte Genom zu einem Baum: http://motherboard.vice.com/read/the-largest-genome-ever-sequenced-belongs-to-a-tree
Ich habe gehört, dass dies möglicherweise daran liegen könnte, dass Bäume viele Duplikate bestimmter Gene benötigen, da sie ihr ganzes Leben lang direktem Sonnenlicht ausgesetzt sind.
Kennt jemand einige spezifische wissenschaftliche Hypothesen, warum dies der Fall sein könnte?
Diese Studie der kürzlich sequenzierten Kiefernarten besagt, dass 82 % des Genoms repetitiv sind . Dies ist charakteristisch für jedes komplexe Genom, einschließlich des Menschen. Solche Sequenzen wurden oft als „ Müll-DNA “ angesehen, obwohl Ihnen jeder Wissenschaftler sagen wird, dass nur weil wir ihren Zweck nicht kennen, dies nicht bedeutet, dass sie keinen hat. Allerdings ist ein guter Teil der Wiederholungen auf transponierbare Elemente zurückzuführen , effektiv intrazelluläre Parasiten, deren einziger Zweck vermutlich die Selbstverstärkung ist und die meistens schädlich sind. Diese eingestreuten Wiederholungen machen etwa 45 % des menschlichen Genoms aus. In diesem Artikel wird erwähnt, dass basierend auf der Sequenzhomologie ~ 65 % des Genoms der Kiefer aus diesen Wiederholungen bestehen (das sind 15 Milliarden Basenpaare).
Es ist interessant, dass das Genom der Kiefer, obwohl es etwa siebenmal größer ist als das eines Menschen, nur doppelt so viele vorhergesagte Gene enthält. Die Kiefer hat ungefähr 50.000 hypothetische Gene, aber nur ungefähr 16.000 sind das, was die Autoren als hohes Vertrauen bezeichnen. Als das menschliche Genom zum ersten Mal sequenziert wurde, gab es ungefähr 35.000 hypothetische Gene, aber jetzt, ungefähr 10 Jahre später, gibt es nur noch ungefähr 21.000 vorhergesagte Gene. Es scheint zu früh, die beiden zu vergleichen. Dies bringt auch den wichtigen Punkt hervor, dass die Anzahl der Gene nicht unbedingt mit der Komplexität des Organismus zusammenhängt: Der Wurm C. elegans hat etwa 20.000 Gene.
Aus dem Papier:
Die große Genomgröße wurde hauptsächlich einem umfangreichen Beitrag von eingestreuten repetitiven Inhalten zugeschrieben (Morse et al. 2009; Kovach et al. 2010; Wegrzyn et al. 2013). Die Assemblierung des Genoms der Rotfichte hat gezeigt, dass insbesondere LTR-Retrotransposons häufig in den langen Introns einiger Genfamilien verschachtelt sind (Nystedt et al. 2013). Darüber hinaus gibt es Hinweise auf Genduplikationen, Pseudogene und Paraloge, deren Ausmaß jedoch nicht klar ist (Kovach et al. 2010; Pavy et al. 2012).
Ich habe noch nie von der Hypothese gehört, die Sie erwähnen (nicht, dass das etwas bedeutet), aber es scheint mir, dass es viel zu früh ist, um dies zu sagen.
David