Ich surfe auf der NCBI-Website – Nucleotide – um einige Beispiele für echte DNA-Sequenzen zu finden, die ich in meinem kleinen Hausaufgabenprojekt verwenden kann.
Meine Frage bezieht sich auf den Titel einer DNA-Sequenz unten:
Sus scrofa mitochondriale DNA, D-Loop-Region, Isolat: Europäisches Wildschwein 3
1.045 bp lineare DNA
Ich dachte, eine mitochondriale DNA unterscheidet sich von einer linearen / nuklearen DNA, insbesondere, dass eine mitochondriale DNA kreisförmig ist, während eine lineare / nukleare DNA linear ist. Was bedeutet der obige Titel eigentlich (in einfachen Worten)? Ist es noch linear oder nicht?
Nun, mitochondriale DNA KANN linear sein (in einigen Organismen), siehe die Wikipedia-Seite dazu
In den meisten vielzelligen Organismen ist die mtDNA – oder Mitogenom – als ringförmige, kovalent geschlossene, doppelsträngige DNA organisiert. Aber auch in vielen Einzellern (z. B. den Ciliaten Tetrahymena oder der Grünalge Chlamydomonas reinhardtii) und in seltenen Fällen auch in Vielzellern (z. B. in einigen Cnidaria-Arten) findet sich die mtDNA als linear organisierte DNA. Die meisten dieser linearen mtDNAs besitzen Telomerase-unabhängige Telomere (dh die Enden der linearen DNA) mit unterschiedlichen Replikationsmodi, was sie zu interessanten Forschungsobjekten gemacht hat, da viele dieser einzelligen Organismen mit linearer mtDNA bekannte Pathogene sind.[19]
Für menschliche mitochondriale DNA (und wahrscheinlich für die von Metazoen im Allgemeinen) sind normalerweise 100-10.000 separate Kopien von mtDNA pro Zelle vorhanden (Ei- und Samenzellen sind Ausnahmen). Bei Säugetieren besteht jedes doppelsträngige ringförmige mtDNA-Molekül aus 15.000–17.000[20] Basenpaaren. Die beiden mtDNA-Stränge werden durch ihren Nukleotidgehalt unterschieden, wobei ein Guanin-reicher Strang als schwerer Strang (oder H-Strang) und ein Cytosin-reicher Strang als leichter Strang (oder L-Strang) bezeichnet wird. Der schwere Strang codiert 28 Gene und der leichte Strang codiert 9 Gene für insgesamt 37 Gene. Von den 37 Genen sind 13 für Proteine (Polypeptide), 22 für Transfer-RNA (tRNA) und zwei für die kleinen und großen Untereinheiten der ribosomalen RNA (rRNA). Dieses Muster ist auch bei den meisten Metazoen zu sehen, obwohl in einigen Fällen eines oder mehrere der 37 Gene fehlen und der mtDNA-Größenbereich größer ist. Bei Pilzen und Pflanzen gibt es noch größere Unterschiede im Gehalt und in der Größe der mtDNA-Gene, obwohl es anscheinend eine Kernuntergruppe von Genen gibt, die in allen Eukaryoten vorhanden sind (mit Ausnahme der wenigen, die überhaupt keine Mitochondrien haben). Einige Pflanzenarten haben riesige mtDNAs (bis zu 2.500.000 Basenpaare pro mtDNA-Molekül), aber überraschenderweise enthalten selbst diese riesigen mtDNAs die gleiche Anzahl und Art von Genen wie verwandte Pflanzen mit viel kleineren mtDNAs.[21]
https://en.wikipedia.org/wiki/Mitochondrial_DNA
Im Fall Ihrer Sequenz bedeutet dies nur, dass sie als lineares DNA-Stück in NCBI eingegeben wurde (dies ist normalerweise der Fall, wenn Sie beispielsweise nur ein Stück einer zirkulären DNA sequenzieren). Dies bedeutet nicht, dass dies innerhalb des Organismus der Fall ist es ist linear!
Ich hoffe, das beantwortet Ihre Frage!