Was ist der MHC-Haplotyp?

Ein Haplotyp wird allgemein definiert als

...eine Gruppe von Genen innerhalb eines Organismus, die gemeinsam von einem einzigen Elternteil geerbt wurde. -- Natur szitierbar

Diese Definition des Haplotyps gilt unabhängig davon, ob es sich nur um einige wenige Gene oder um alle Gene auf einem gesamten Chromosom handelt$^1$. Beim Haupthistokompatibilitätskomplex handelt es sich um eine Gruppe von mehr als 200 Genen auf Chromosom 6 (Janeway et al. 2001). Die Menge der Allele$^1$zusammen von einem Elternteil vererbt, bilden den MHC-Haplotyp. Somit erbt ein Nachkomme zwei verschiedene MHC-Haplotypen, einen von jedem Elternteil. Die verschiedenen Haplotypen mit so vielen Genen tragen dazu bei, die genetische Variation im Gesamtkomplex aufrechtzuerhalten, was die Immunantwortfähigkeit des Organismus verbessert.

Der Begriff leitet sich von haploid ab , was die Hälfte des normalen Chromosomensatzes bedeutet. Menschen zum Beispiel sind diploid , was bedeutet, dass sie zwei Kopien jedes Chromosoms haben, eine von der Mutter (mütterlich) und eine vom Vater (väterlich). Wenn Sie also nur eine Hälfte des Chromosomenpaars erben, erben Sie einen Haplotyp.

Als allgemeine Referenz ist es wichtig zu beachten, dass der Haplotyp nicht immer verwendet wurde, um auf eine Gruppe von zwei oder mehr Genen zu verweisen, die zusammen vererbt wurden. Es wurde allgemein als Begriff verwendet, um eine Sequenz von Nukleotiden zusammen auf demselben Chromosom darzustellen, selbst wenn es nur ein Teil eines einzelnen Gens ist. Beispielsweise haben Bowen et al. (1995) verwendeten mitochondriale Haplotypen, um die Migration von Unechten Karettschildkröten über den Pazifischen Ozean zu untersuchen. Sie nutzten 350 Nukleotide der mitochondrialen Kontrollregion . Die Kontrollregion ist über 1000 Nukleotide groß, aber Bowen und Kollegen verwendeten nur 350 Nukleotide aus einem Teil der Kontrollregion. Diese Verwendung war in den 1990er und frühen 2000er Jahren weit verbreitet, bevor es einfacher und kostengünstiger wurde, ganze Genome oder zumindest viele Gene zu sequenzieren.

Zitat

Bowen, BWet al. 1995. Transpazifische Wanderungen der Unechten Karettschildkröte (*Caretta caretta), demonstriert mit mitochondrialen DNA-Markern. Verfahren der National Academy of Sciences USA 92: 3731-3734.

Janeway, Jr., CA et al. 2001. Immunobiology , 5. Auflage. Garland Science, New York.

Fußnote

1. Genauer gesagt wäre es der Satz von Allelen an jedem Genort (Genort), der zusammen vererbt wird. Die gleichen Gene werden von beiden Elternteilen geerbt, aber die Allele (Variationen des Gens) können zwischen den beiden Elternteilen unterschiedlich sein.

Wie im Wiki angegeben, ist der Haupthistokompatibilitätskomplex (MHC) ein Satz von Zelloberflächenmolekülen, die von einer großen Genfamilie in allen Wirbeltieren kodiert werden und einen Großteil des Immunsystems kontrollieren. MHC-Moleküle vermitteln Interaktionen von Leukozyten, auch weiße Blutkörperchen genannt (WBCs), bei denen es sich um Immunzellen handelt, mit anderen Leukozyten oder mit Körperzellen. MHC bestimmt die Verträglichkeit von Spendern für Organtransplantationen sowie die Anfälligkeit für eine Autoimmunerkrankung durch kreuzreagierende Immunisierung. Beim Menschen wird MHC auch als humanes Leukozyten-Antigen (HLA) bezeichnet )."

Grundsätzlich kontrollieren MHC das Immunsystem und funktionieren nach dem Prinzip Schloss und Schlüssel. MHC hat eine spezifische Zelloberfläche, die an Fremdmaterialien binden kann, die eine kompatible Bindungsstelle haben, und es als Pathogen oder schädliche Verbindung erkennen kann.