Was ist eine selektive Einschränkung?

Der Begriff der selektiven Beschränkung ist mir bei Huber et al. begegnet. 2015 , Seite 4 (letzter Absatz) in:

Wenn unveränderliche Stellen in die Analyse einbezogen werden, können sowohl die Methoden von Kim und Stephan (2002) als auch Nielsen et al. (2005) können empfindlich auf Annahmen bezüglich selektiver Einschränkungen und Mutationsraten reagieren.

aber der Kontext hilft nicht ganz weiter.

Was ist die Definition von selektiver Beschränkung?

Hat es mit tödlichen Mutationen in nicht kodierenden Regionen zu tun? Hat es mit Selektionsinterferenz zu tun? ...

Bitte verwenden Sie die Anführungszeichen-Umgebung anstelle der Code-Umgebung (soweit ich weiß, werden die meisten Screenreader dies Zeichen für Zeichen lesen).

Antworten (1)

Es ist selektiver Druck, der die Anzahl der neutralen/vorteilhaften Mutationen, die stattfinden können, bestimmt und begrenzt. Je eingeschränkter ein Locus selektiert wird, desto einfacher ist es, schädliche Mutationen zu erzeugen, und desto schwieriger ist es, nützliche Mutationen zu erzeugen; Dies kann sich in niedrigen Substitutionsraten an solchen Orten in Populationen im Laufe der Zeit widerspiegeln.

Eine weit verbreitete Methode, dies zu messen, besteht darin, das Ka/Ks-Verhältnis zu berechnen, um abzuleiten, ob ein Ort selektiv eingeschränkt ist oder nicht.

+1 Danke. Können wir diesem Konzept einen Wert zuordnen? Beispielsweise könnte die selektive Einschränkung sein S = K A / K A oder S = M u B / M u D , Wo M u B Und M u D sind die vorteilhaften bzw. schädlichen Mutationsraten.
Es ist einfacher, Ka und Ks zu messen, wenn also etwas unter keiner Auswahl (neutral) steht, sehen Sie ein Verhältnis von 1, weniger als 1 zeigt eine reinigende Auswahl an, mehr als 1 zeigt eine positive Auswahl an. Mehr hier cs.mun.ca/~banzhaf/papers/ppsn08_evorate.pdf
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