Während der DNA-Replikation werden die nebeneinander liegenden synthetisierten Okazaki-Fragmente direkt durch DNA-Ligase-katalysierte Phosphodiester-Bindungsbildung verbunden. Kann mir jemand sagen, welcher Teil dieser Aussage sagt, dass es falsch ist? Ich weiß nur, dass die Fragmente durch DNA-Ligase miteinander verbunden sind, was nur bedeuten kann, dass der Teil über die Phosphodiesterbindung falsch ist, aber sind die 2 Nukleotide nicht durch eine Phosphodiester-Aka-Nukleotidbindung verbunden?
Ich bin mir ziemlich sicher, dass der Teil "Phosphodiesterbindung" richtig ist.
Das einzige, was mir einfällt, was fragwürdig sein könnte, ist das Wort "direkt". Wenn direkt = sofort, dann könnte der Satz falsch genannt werden, weil sie nicht sofort verbunden werden.
Selbst dann scheint es, als würde man nur nach Strohhalmen greifen, also würde ich mir darüber keine allzu großen Sorgen machen. Es hört sich so an, als ob Sie das Konzept verstehen, worauf es ankommt.
Die beste Vermutung, die ich machen könnte, ist "direkt". Okazaki-Fragmente enthalten auch RNA-Primer, die durch DNA-Fragmente ersetzt werden müssen. Aus diesem Grund ist das Zusammenfügen von Okazaki-Fragmenten ein etwas längerer Prozess. Kurz gesagt, die RNA-Primer werden zuerst durch Flap-Endonuklease I entfernt und durch DNA-Polymerase ersetzt , danach werden diese Fragmente durch DNA-Ligase I verbunden. Ich würde vorschlagen, dass Sie den Wikipedia- Artikel über Okazaki-Fragmente lesen.
Die Reifung des Okazaki-Fragments beinhaltet eine Lückenfüllung (zwischen benachbarten Okazaki-Fragmenten) und eine Strangverdrängung (5'-Ende des nachgeschalteten Okazaki-Fragments) DNA-Synthese durch DNA-Polymerase δ (Polδ), die einen ligierbaren Nick erzeugt; die geschnittene DNA ist das Substrat für die DNA-Ligase.
Okazaki-Fragmente heften sich nicht nebeneinander an den nacheilenden Strang an, sondern heften sich zufällig in einem gewissen Abstand voneinander an.
David