Wie erfolgt die rho-abhängige Terminierung?
Tyto alba
Die Rho-abhängige Terminierung ist nicht vollständig verstanden, aber es gibt eine kurze Beschreibung in fast jedem betroffenen Buch darüber.
In Snustard und Instant Notes -Molecular Biology steht geschrieben, dass das Rho-Protein einen Abschnitt von 72 Nukleotiden am 3'-Ende der entstehenden RNA bindet, der eine Erkennungsstelle sein könnte, und sich dann entlang der 5' -> 3'-Richtung trennt das DNA-RNA-Hybrid.
Aber wie ist es möglich, Rho an das 3'-Ende zu binden (das nicht frei ist) und sich in 5'-> 3' zu bewegen (wenn ja, fällt es sicher ab!)?
Das Diagramm von Berg zeigt etwas Gegenteiliges, dh es hat sich am 5'-Ende befestigt und bewegt sich in 5' -> 3'-Richtung.
Was ist das Richtige?
Antworten (2)
Kanadier
Es gibt keine Dichotomie in den beiden Quellen, die Sie beschrieben haben. Das Lehrbuch, auf das Sie verlinkt haben, sagt genau (Hervorhebung hinzugefügt):
Rho scheint an eine Strecke von 72 Nukleotiden in der Nähe des 3'-Endes der entstehenden RNA zu binden ...
Es steht nicht am 3'-Ende, was offensichtlich unmöglich ist, da das 3'-Ende innerhalb der Transkriptionsblase ein doppelsträngiges Hybrid bildet. Rho wird auch nicht am 5'-Ende der RNA geladen, sondern bindet intern an Cytidin-reichen Rho-Nutzungsstellen (rut), die sich irgendwo 5' vom eigentlichen Punkt der Transkriptionstermination befinden. Wie Sie bereits erwähnt haben, gibt es viel Unsicherheit in diesem Prozess, und obwohl viel über Brunftstellen bekannt ist, gibt es meines Wissens nach keine Konsenssequenz, was es schwierig macht, Brunftstellen im gesamten Genom systematisch zu identifizieren. Ich habe Veröffentlichungen gefunden, die rut-Stellen in der 5'-UTR ( 1 ) sowie innerhalb der 3'-UTR, intercistronische Regionen und codierende Sequenzen ( 2 , 3 ,).
Mechanismus der internen Rho-Beladung:
Noah
Dein Diagramm ist richtig. Das Rho-Protein bindet am 5'-Ende und "jagt" die RNA-Polymerase. Es ist dem Rho-Protein nicht möglich, am 3'-Ende zu binden, da dieses noch nicht von RNA-Polymerase transkribiert wurde.
Was bedeutet es, die RNA-Polymerase zu schützen?
Bewegt sich die RNA-Polymerase um die DNA herum oder dreht sich die DNA unter der Polymerase?
Mechanismus der RNA-Synthese durch RNA-Polymerase [geschlossen]
Wie wird die Transkriptionsrate durch die Temperatur beeinflusst?
Hat irgendein Molekül außer DNA eine Doppelhelixstruktur?
Was ist eine DNA-bindende Domäne?
Was ist die biochemische Erklärung für Kribbeln und Brennen im Gehirn aufgrund bestimmter Nahrungsmittel?
Zwei fluoreszierende Proteine mit unterschiedlichen Promotoren im selben Plasmid klonen?
Wie beeinflusst die Promotorsequenz die Initiation?
Designregeln für DNA-Linker
Vance L. Albaugh