Ich bin etwas verwirrt darüber, wie der Name der Bindung zwischen dem Phosphat und dem Zucker innerhalb eines Nukleotids lautet. Alles, was meine Forschung hervorbringt, ist eine Phosphodiesterbindung, die das Rückgrat der DNA ist. Aber würden wir es innerhalb eines einzelnen Nukleotids vielleicht eine Phosphoesterbindung nennen (alle meine Suchen nach Phosphoesterbindung korrigieren es zu Phosphodiester, daher glaube ich nicht, dass der Begriff "Phosphoester" verwendet wird ...); oder wäre es vielleicht eine O-glykosidische Bindung, da es sich um ein Zuckermolekül handelt, das über ein O-Atom kovalent an ein anderes Molekül gebunden ist?
Phosphoester ist ein gültiger Begriff. Es gibt mindestens 1000 Peer-Review-Artikel , die diesen Begriff verwenden. IUPAC Goldbook definiert Nukleotide als:
Verbindungen, die formal durch Veresterung der 3- oder 5-Hydroxygruppe von Nukleosiden mit Phosphorsäure erhalten werden. Sie sind die Monomere von Nukleinsäuren und werden aus ihnen durch hydrolytische Spaltung gebildet.“
Phosphoester oder Phosphorsäureester bedeutet einen Ester der Phosphorsäure.
Erweiterung der richtigen Antwort von WIYSIWG:
Jedes Nukleotid enthält eine Phosphoesterbindung (zwischen einem Phosphat-O und einem Zucker-5'-C). Zusätzlich sind zwei Nukleotide durch eine Phosphoesterbindung verbunden (zwischen einem Phosphat-O und einem Zucker-3'-C). In einem Polymer aus mehreren Nukleotiden (DNA, RNA) enthält die sich wiederholende Monomereinheit also zwei Phosphoesterbindungen, „oben“ (5') und „unter“ (3') dem Zucker. Da die sich wiederholende Einheit zwei Phosphoesterbindungen enthält und die Phosphate sich mit den Zuckern in der Sequenz abwechseln, nennen wir dies ein Zucker-Phosphat-Rückgrat, das durch Phosphodiesterbindungen/-bindungen zusammengehalten wird .
Schema eines einzelnen Nukleotids mit vertikaler Linie als Phosphoesterbindung (bis 5 'C):
Zwei Nukleotide, jedes mit einer internen Phosphoesterbindung und einer neuen Phosphoesterbindung, die sie verbindet (überspannt 5' eines Zuckers bis 3' des nächsten):
Sich wiederholende Einheit im Nukleotidpolymer mit alternierendem Zucker-Phosphat-Rückgrat und einer Phosphodiesterbindung /-verknüpfung pro Einheit/Nukleotidrest (die ... Ellipsen zeigen an, dass sich das Muster für das gesamte Nukleinsäurepolymer fortsetzt, wobei Hydroxylgruppen die äußersten Enden bedecken):
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