Wie kann ich Gene auflisten, die auf einer bestimmten Reihe von Banden vorhanden sind?

Meine Frage bezieht sich auf diese . Mein Interesse bezieht sich auf diese Löschung:

del(7)(q11q36)[12]

wie von ISCN definiert .

Ich möchte auf eine Liste der Gene zugreifen, die auf den Bändern 11 bis 36 des 7. Chromosoms beim Menschen gefunden werden. Wie kann ich das machen?

Antworten (1)

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Hier finden Sie eine kurze Anleitung zur Suche nach Bands. Hier ist ein ausführlicheres Hilfedokument, und hier ist eine menschenspezifische Hilfeseite. Grundsätzlich:

  1. Wählen Sie die Arten- und Anmerkungsfreigabe aus. Wir sind übrigens Homo sapiens ...
  2. Wählen Sie das gewünschte Chromosom aus.
  3. Auf der linken Seite der Seite steht Region Shown:gefolgt von zwei Eingabefeldern. Sie können anhand der standardmäßigen zytogenetischen Nomenklatur nach Banden suchen: 7q11und 7q36. Geben Sie diese in die Eingabefelder ein und klicken Sie auf Go. Hier ist 7q11:7q36.
  4. Es gibt verschiedene Links zum Herunterladen von Daten. Am relevantesten für Sie ist vielleicht, dass sich links auf der Seite ein Link mit der Aufschrift befindet Data As Table View. Hier ist diese Seite, eine Liste von Genen auf verschiedenen Charakterisierungsebenen.

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Hier ist eine Tabelle mit verschiedenen Suchanfragen, die Sie verwenden können. Es gibt mehrere Möglichkeiten, die Daten zu analysieren:

Interaktiver Genombrowser:

  1. Klicken Sie auf Genome Browser.
  2. Geben Sie im Suchfeld die zytogenetischen Koordinaten ein: 7q11;7q36. Drücken Sie Go. Hier ist die resultierende Seite.

Tabellenbrowser (zum Herunterladen von Daten):

  1. Klicken Sie auf Tools > Table Browser.
  2. Es gibt viele Möglichkeiten. Eine Anleitung finden Sie hier . Am wichtigsten für Ihre Suche ist region. Wählen Sie das positionOptionsfeld und geben Sie Ihre zytogenetischen Koordinaten ein. Die restlichen Optionen überlasse ich Ihnen.
Gute Antwort! Ich mag dir direkt das kleine Tutorial angeboten und nicht nur Links zu Erklärungen. Mir gefällt auch, dass Sie den Slogan für jede Datenerhebung verwendet haben. Danke
@Remi.b Gern geschehen, ich hoffe, Sie finden, wonach Sie suchen.