Wie viele mögliche Codons?

Man betrachte ein Codon der Form NNK (wobei N = A- Denin, Cytosin , Guanin oder U- Racil & K = U- Racil oder Guanin ). Wie viele Codons sind jetzt verfügbar? Ich weiß, wenn alle verfügbar wären, gäbe es 4 ^ 3 = 64 Codons. Wie viele sind jetzt möglich? Als ich Kombinationen manuell ausprobiert habe, kam ich auf 32, ist das richtig?

4 * 4 * 2 = 32.
Was ist mit N und NN von NNK gemeint? Bedeutet das, dass die ersten 2 Nukleotide gleich sein müssen?

Antworten (2)

Ja, 32 ist richtig.

Technisch gesehen habe ich nichts hinzuzufügen, was Gerardo Furtado und ein Tiger nicht bereits erwähnt haben, aber eine grafische Darstellung aller Permutationen könnte helfen, dies ein bisschen besser zu verstehen.

Für die ersten 2 Positionen im Codon haben wir 4 Basen zur Auswahl ( a Denin, Guanin , U Racil und Cytosin ). Dies kann also mathematisch als 4 x 4 = 16 oder visuell dargestellt werden als:

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Für die nächste Position (die interessierende Position) haben wir nun nur noch zwei Basen zur Auswahl ( u racil und guanine ). Bleiben wir bei 4 x 4 x 2 = 32 verschiedenen Permutationen, oder visuell:

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Gern geschehen. Ich bin froh, dass es geholfen hat.

Ja, so ist es.

Gerardo Furtado hat in den Kommentaren bereits eine kurze Antwort gegeben, aber lassen Sie mich erklären, warum.

Die 4^3 = 64, wenn alle Basen frei wählbar sind, ergibt 4*4*4=64, weil Sie für jede der 3 Basen aus 4 Optionen wählen können.

Wenn Sie die Möglichkeiten einer der Basen einschränken, zB gibt es für die dritte Base nur 2 Möglichkeiten (wie in Ihrem Beispiel), ändert sich die Formel auf 4*4*2=32, da Sie für die jeweils 4 Möglichkeiten wählen können ersten 2 Basen und ab 2 Optionen für die 3. Base.

Bearbeiten: Wenn die 2 'N's von 'NNK' gleich sein müssen, können Sie die erste Basis frei wählen (4 Optionen), die zweite Basis ist bereits definiert (sie muss die gleiche sein wie die erste Basis, 1 Option) und es gibt 2 Optionen für die 3. Basis, wie oben beschrieben. Somit erhalten wir 4*1*2=8 mögliche Codons

Ich hoffe ich konnte das klären.

Gute Erklärung. Der Vollständigkeit halber wäre es äußerst ungewöhnlich, wenn NNKdarauf hingewiesen würde, dass die ersten beiden Basen identisch sein müssten: Zunächst einmal ist es nicht die Konvention; IUPAC-Mehrdeutigkeitscodes sind Zeichenplatzhalter, keine Variablen im üblichen mathematischen Sinne. Und zweitens gibt es wenig biologischen Grund, Codons in Betracht zu ziehen, bei denen die ersten beiden Basen identisch sind.
Ich stimme absolut zu.
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