Wird die Promotorregion eines Gens transkribiert?

Wenn sich die RNA-Polymerase an die Promotorregion des Gens anheftet, würde sie das anfängliche mRNA-Segment bilden, indem sie die Promotorregion liest, oder würde sie über die DNA gleiten und dann die angrenzende Region lesen? Oder überspannt das Enzym so lange, dass seine bestimmte Region an den Promotor bindet, während seine benachbarte Region beginnt, die DNA zu lesen, um mRNA zu bilden?

Liest die RNA-Polymerase DNA-Basenpaare und fügt die komplementären RNA-Basenpaare nacheinander hinzu? Oder liest es Gruppen von Basenpaaren genau wie tRNA, die Basentripletts liest?

Wird die Terminatorregion ebenfalls transkribiert, bevor der Transkriptionsprozess endet, oder endet die Transkription unmittelbar nachdem die RNA-Polymerase die Terminatorregion erreicht hat? Wenn letzteres der Fall ist, wie endet die Transkription, nur indem die Polymerase die Terminatorregion liest?

Sollten also die Promotor- und Terminatorregionen eines Gens als Teile des Gens oder als separate Einheiten betrachtet werden?

In genomischen Annotationen wird davon ausgegangen, dass Gene an der ersten Base beginnen, die in einem sequenzierten Transkript gefunden wird, und in der letzten Base eines sequenzierten Transkripts enden.
Zu viele Fragen, zu wenig Aufwand.

Antworten (1)

würde es den anfänglichen mRNA-Teil bald nach der Anheftung durch Ablesen der Promotorregion bilden?

Die RNA-Polymerase bindet an den Promotor, da sie jedoch so groß ist, hängt ihr vorderes Ende am Ende des Promotors herunter. Wenn die Transkription beginnt, ist der Promotor nicht enthalten, da der Transkriptionsprozess an der Vorderseite der Polymerase stattfindet.

Förderregion

Liest die RNA-Polymerase auch die DNA-Basenpaare einzeln und fügt die RNA-Basenpaare der Kette einzeln hinzu?

Die RNA-Polymerase fügt nacheinander Nukleosidtriphosphat (NTP) hinzu. Wie das Bild unten zeigt, ist im aktiven Zentrum nur Platz für ein NTP, und sobald das richtige NTP platziert ist, wird es der RNA-Kette hinzugefügt.

RNA-Polymerase II

Wie endet der Prozess nur durch das Lesen der Terminatorregion?

Die Frage der Terminierung ist abhängig von der Zelle. Prokaryoten terminieren entweder in einem Rho-unabhängigen oder -abhängigen Prozess. Unabhängig davon tritt in der RNA eine Haarnadel auf, die das Transkript abbricht, abhängig davon bindet ein Rho-Faktor, der die Termination bewirkt. Eukaryoten sind weniger bekannt, aber es wird allgemein angenommen, dass es nach der Poly-A-Stelle auch Faktoren gibt, die binden und Termination induzieren.

Sollten also die Promotor- und Terminatorregion eines Gens als Teile des Gens oder als getrennte Einheiten betrachtet werden?

Bei dieser Frage geht es etwas mehr um Definitionen als um Biologie. Das Oxford English Dictionary definiert ein Gen als „die Grundeinheit der Vererbung in lebenden Organismen“. Da der Promotor, die nicht-codierenden und die nicht-übersetzenden Regionen immer noch von größter Bedeutung sind, um das Protein herzustellen, würde ich argumentieren, dass sie immer noch Teil des Gens und der größeren erblichen Einheit sind.

Wird die Promotorregion eines Gens transkribiert?
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