Es ist ein wichtiges Gen, das in E. coli exprimiert wird , das die SOS-Antwort und auch die Expression von Genen der Lambda-lytischen Phase unterdrückt. UV-Licht und Schäden an der DNA sind für deren Abbau und damit für die Expression von Reparaturgenen und, falls vorhanden, Lambda-Phagen-Genen verantwortlich. Ich konnte jedoch keine Referenz für seinen ursprünglichen Namen finden.
Ich würde mich für Lambda-Exzision A entscheiden. Begriffe wie lex oder rec stehen oft für eine sogenannte Eselsbrücke, wobei rec beispielsweise für Rekombination oder umu für UV-Mutator stehen kann. Die Namenskonventionen können schwierig sein.
Bearbeiten: Eine Studie von Roger Brent und Mark Ptashne aus dem Jahr 1981 stellt einige Daten aus ersten Studien fest, die zeigten, dass der lexA-Repressor eine Reihe von Genen herunterreguliert, einschließlich himA, die ihrer Meinung nach für die Integration des Lambda-Phagen erforderlich sind.
Laut dieser Website ist es eine Eselsbrücke für "Lambda-Exzision". Ich habe diese Verwendung auch in der wissenschaftlichen Literatur gefunden (z. B. Harami et al., 2013). Keine dieser Quellen verweist jedoch auf irgendetwas, und ich kann kein Definitionspapier finden. Fast alle Zeitungen bezeichnen es einfach als lexA.
Soweit ich finden kann (es ist schwierig, diese alten Papiere auszugraben), wurde der Locus (nicht unbedingt das Gen) ursprünglich so beschrieben (Howard-Flanders und Boyce, 1966):
Es gibt in E. coli K-12 einen ... Locus, Lex (Locus für Röntgenempfindlichkeit), ... [A]-Mutation an diesem Locus erhöht das Ausmaß des UV-induzierten DNA-Abbaus. Dieser Effekt ist ähnlich, aber weniger extrem als der des Rec- Lokus ...
Es ist möglich, dass, da dieser Ort besser charakterisiert war, der Name lex aus Gründen der Übereinstimmung mit der früheren Literatur beibehalten, aber neu definiert wurde, um ein besseres Verständnis seiner Funktion widerzuspiegeln (obwohl ich nicht glaube, dass "Lambda-Exzision" dies sehr gut macht).
Verweise
Harami GM, Gyimesi M, Kovacs M. 2013. Von Schlüsseln zu Bulldozern: Erweiterung der Rollen für geflügelte Helixdomänen in Nukleinsäure-bindenden Proteinen. TrendsBiochem Sci 38(7):364–371
Howard-Flanders P, Boyce RP. 1966. DNA-Reparatur und genetische Rekombination: Studien an Mutanten von Escherichia coli , die in diesen Prozessen defekt sind. Radiat Res Supp 6:156-184
Lee Theriots röntgenempfindliche Mutante https://thebradentontimes.com/lee-frances-theriot-p24426-154.htm Ich war damals Postdoc bei Joseph Greenberg und arbeitete auf demselben Gebiet
Dies ist gut dokumentiert in Advances in Microbial Physiology , Band 16, Moseley und Williams, Seiten 116–117 (durchsuchbar über Google Books).
Matternet al. (1966) bezeichneten Mutationen, die E. coli Bs-1 gegenüber Röntgenstrahlung empfindlich machten, als exr (Röntgenempfindlichkeit)-Mutationen. Im selben Jahr bezeichneten Howard-Flanders und Boyce (1966) äquivalente Mutationen in E. coli K-12 unabhängig voneinander als lex (Lokus für Röntgenempfindlichkeit). In beiden Stämmen befanden sich diese Mutationen in der Nähe des malB- Locus ( b4039 ; lexA ist b4043 ). Ein Jahr später verwendete Greenberg eine breitere Bezeichnung mit derselben kausalen Wurzel (Loci für Strahlenempfindlichkeit), um dieselben Mutationen zu bezeichnen.
LexA ist auch als umuA ( UV-induction of mutations ) und tsl ( thermosensitive mutations ) bekannt.
Tel
What does gene name X stand for?Ich denke, Sie erwarten vielleicht ein bisschen zu viel von den Standard-Namenskonventionen ...vajra78
rhill45
CKM