Was genau passiert, wenn kompetente Zellen wie DH5ɑ mit vorhandener DNA einem Hitzeschock unterzogen werden? Wie kommt die DNA in die Zellen?
Insbesondere, warum sind all die Schritte notwendig? Was ist, wenn Sie direkt nach dem Hinzufügen von DNA einen Hitzeschock bekommen? Was ist, wenn Sie nach einem Hitzeschock nicht auf Eis legen? Was bewirkt das Calciumchlorid? Was passiert eigentlich, wenn Zellen „kompetent“ sind? Was bestimmt die Transformationseffizienz (abgesehen von offensichtlichen Dingen wie der Menge an DNA oder Zellen)?
Um zu verdeutlichen, wovon ich spreche, verwende ich ein Protokoll wie das folgende:
Ich bekomme normalerweise Tausende von Kolonien daraus (tatsächlich ist oft eine Verdünnung von 1:10 oder 1:100 erforderlich, damit ich tatsächlich isolierte Kolonien bekommen kann). Selbst wenn ich den Auswuchs überspringe, bekomme ich immer noch Hunderte.
Ich habe nicht mein kompetentes Zellprotokoll, aber im Grunde verwende ich das eine Rubidiumchlorid, das jeder verwendet: DH5ɑ-Zellen werden mit einigen Puffern gewaschen, in einer Lösung mit CaCl2 und RbCl suspendiert und dann in flüssigem Stickstoff eingefroren. Ich habe nie wirklich gemessen, aber normalerweise ist die Konzentration der Zellen in den gefrorenen Aliquots etwa 10-mal so hoch wie bei einer Flüssigkultur über Nacht (sie werden heruntergeschleudert und in einem kleinen Volumen resuspendiert).
Die Hitzeschocktransformation verändert die Fluidität der Membran und erzeugt Poren:
Ein plötzlicher Temperaturanstieg erzeugt Poren in der Plasmamembran der Bakterien und ermöglicht das Eindringen von Plasmid-DNA in die Bakterienzelle.
Referenz: Zeitschrift für visualisierte Experimente. Bakterielle Transformation: Die Hitzeschockmethode. 2014. http://www.jove.com/science-education/5059/bacterial-transformation-the-heat-shock-method
Die Temperaturänderung verändert die Fluidität des halbkristallinen Membranzustands, der bei 0 °C erreicht wird, wodurch das DNA-Molekül durch die Adhäsionszone in die Zelle eindringen kann.
Referenz: Anh-Hue T. Tu. Transformation von Escherichia coli Kompetent gemacht durch Calciumchloridprotokoll. 2008-2013. Amerikanische Gesellschaft für Mikrobiologie
... Wärmeimpulsschritt (0 Grad C42 Grad C) des Standardtransformationsverfahrens hatte die Fluidität der äußeren Membran der Zellen erheblich verringert. Die Abnahme der Fluidität wurde durch die Freisetzung von Lipiden von der Zelloberfläche in das extrazelluläre Medium verursacht. Ein anschließender Kälteschock (42 Grad C0 Grad C) auf die Zellen erhöhte die Fluidität weiter auf ihren ursprünglichen Wert, was durch die Freisetzung von Membranproteinen in das extrazelluläre Medium verursacht wurde.
Referenz: Panja S, Aich P, Jana B, Basu T. Wie durchdringt Plasmid-DNA Zellmembranen im künstlichen Transformationsprozess von Escherichia coli? Mol. Mitglied biol. 2008 Aug;25(5):411-22. doi: 10.1080/09687680802187765 . PubMed-PMID: 18651316.
Alan Boyd
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