Wie funktioniert die Hitzeschock-Transformation?

Was genau passiert, wenn kompetente Zellen wie DH5ɑ mit vorhandener DNA einem Hitzeschock unterzogen werden? Wie kommt die DNA in die Zellen?

Insbesondere, warum sind all die Schritte notwendig? Was ist, wenn Sie direkt nach dem Hinzufügen von DNA einen Hitzeschock bekommen? Was ist, wenn Sie nach einem Hitzeschock nicht auf Eis legen? Was bewirkt das Calciumchlorid? Was passiert eigentlich, wenn Zellen „kompetent“ sind? Was bestimmt die Transformationseffizienz (abgesehen von offensichtlichen Dingen wie der Menge an DNA oder Zellen)?

Um zu verdeutlichen, wovon ich spreche, verwende ich ein Protokoll wie das folgende:

  1. Nehmen Sie die Zellen aus -80 ° C und tauen Sie sie 5 Minuten lang auf Eis auf.
  2. Fügen Sie 1 ul (~500 ng) Plasmid-DNA zu 50 ul Zellen hinzu, mischen Sie vorsichtig mit der Pipettenspitze.
  3. 30 min auf Eis lassen.
  4. 45 Sek. in 42C Wasserbad geben.
  5. 10 min auf Eis stellen.
  6. Füge 950 ul LB hinzu, stelle 1 Stunde lang auf 37°C.
  7. 300 µl der Kultur auf LB-Agarplatten mit entsprechender Selektion ausstreichen.

Ich bekomme normalerweise Tausende von Kolonien daraus (tatsächlich ist oft eine Verdünnung von 1:10 oder 1:100 erforderlich, damit ich tatsächlich isolierte Kolonien bekommen kann). Selbst wenn ich den Auswuchs überspringe, bekomme ich immer noch Hunderte.

Ich habe nicht mein kompetentes Zellprotokoll, aber im Grunde verwende ich das eine Rubidiumchlorid, das jeder verwendet: DH5ɑ-Zellen werden mit einigen Puffern gewaschen, in einer Lösung mit CaCl2 und RbCl suspendiert und dann in flüssigem Stickstoff eingefroren. Ich habe nie wirklich gemessen, aber normalerweise ist die Konzentration der Zellen in den gefrorenen Aliquots etwa 10-mal so hoch wie bei einer Flüssigkultur über Nacht (sie werden heruntergeschleudert und in einem kleinen Volumen resuspendiert).

Ich denke, es stimmt immer noch, dass niemand "genau" weiß, was passiert. Es gibt eine verbreitete Weisheit, dass die Membran flüssiger wird (richtig), wenn Zellen bei 37 ° C gezüchtet und dann bei 42 ° C geschockt werden, und dies der DNA hilft, diese Barriere zu überwinden. Wenn jemand eine Antwort mit Beweisen dafür schreibt, bin ich sehr interessiert.
@AlanBoyd Ich habe gehört, dass viele Wissenschaftler auch behaupten, dass niemand es weiß. Ich fand es schon immer seltsam. Wie kann eine so einfache, beliebte Technik nicht gut verstanden werden? Sind die experimentellen Techniken, um es zu studieren, nicht verfügbar? Oder stört es niemanden, weil sie denken, selbst wenn sie es herausfinden, wird es niemanden zitieren oder sich darum kümmern?
Mir wurde auch gesagt/erfahren, dass derselbe Mechanismus für die Transformation von E. coli verantwortlich ist , wie von Alan Boyd geschrieben. Auf dieses Papier (Large-Volume Transformation with High-Throughput Efficiency Chemically Competence Cells. Focus 20:2 (1998)) scheint viel über das Verfahren verwiesen zu werden; Ich weiß jedoch nicht, ob die Studie eine mechanistische Erklärung der hitzeschockbasierten E. coli - Transformation bietet, da ich anscheinend nicht darauf zugreifen/sie finden kann.
Ich bin mir da nicht sicher, aber die natürliche Kompetenz wird durch Umweltstress beeinträchtigt. Vielleicht ist es bei der chemisch induzierten Kompetenz genauso. Siehe diesen Beitrag.

Antworten (1)

Die Hitzeschocktransformation verändert die Fluidität der Membran und erzeugt Poren:

Ein plötzlicher Temperaturanstieg erzeugt Poren in der Plasmamembran der Bakterien und ermöglicht das Eindringen von Plasmid-DNA in die Bakterienzelle.

Referenz: Zeitschrift für visualisierte Experimente. Bakterielle Transformation: Die Hitzeschockmethode. 2014. http://www.jove.com/science-education/5059/bacterial-transformation-the-heat-shock-method

Die Temperaturänderung verändert die Fluidität des halbkristallinen Membranzustands, der bei 0 °C erreicht wird, wodurch das DNA-Molekül durch die Adhäsionszone in die Zelle eindringen kann.

Referenz: Anh-Hue T. Tu. Transformation von Escherichia coli Kompetent gemacht durch Calciumchloridprotokoll. 2008-2013. Amerikanische Gesellschaft für Mikrobiologie

... Wärmeimpulsschritt (0 Grad C42 Grad C) des Standardtransformationsverfahrens hatte die Fluidität der äußeren Membran der Zellen erheblich verringert. Die Abnahme der Fluidität wurde durch die Freisetzung von Lipiden von der Zelloberfläche in das extrazelluläre Medium verursacht. Ein anschließender Kälteschock (42 Grad C0 Grad C) auf die Zellen erhöhte die Fluidität weiter auf ihren ursprünglichen Wert, was durch die Freisetzung von Membranproteinen in das extrazelluläre Medium verursacht wurde.

Referenz: Panja S, Aich P, Jana B, Basu T. Wie durchdringt Plasmid-DNA Zellmembranen im künstlichen Transformationsprozess von Escherichia coli? Mol. Mitglied biol. 2008 Aug;25(5):411-22. doi: 10.1080/09687680802187765 . PubMed-PMID: 18651316.