(Genetik) Ist ein Silencer dasselbe wie Gen-Silencing (Heterochromatin)?

Ist Schalldämpfer dasselbe wie Gen-Stummschaltung? Ich weiß, dass Gen-Silencing sich auf Heterochromatin bezieht, das an den Telomeren oder Zentromeren konzentriert ist. Es hängt auch mit der Methylierung zusammen. Aber was ist mit einem Schalldämpfer. Sind sie gleich? Oder ist Silencer das Gegenteil von Enhancer (Repressor)?

Antworten (1)

Sie sind hier etwas verwirrt mit Ihren Begriffen. Denken Sie daran, wenn Sie über die natürliche Regulation eines Transkriptoms sprechen, können Sie es auf der Ebene des Genoms, des Transkriptoms und des Epigenoms kontrollieren.

Das Repressor-Protein ist ein DNA- oder RNA-bindendes Protein, das die Expression eines oder mehrerer Gene hemmt, indem es an den Operator oder assoziierte Silencer bindet. Je nachdem, wo es bindet, reguliert es auf Ebene des Genoms oder des Transkriptoms.

Die Gen-Silencer-Region ist eine DNA-Sequenz im Genom, die es Repressorproteinen ermöglicht, daran zu binden. Es befindet sich normalerweise sehr nahe am Promotor des Gens, das es kontrollieren möchte. Dies kontrolliert die Expression des Gens auf der Ebene des Genoms, um die Transkription des Gens zu unterdrücken. Es gibt ein paar Typen (Classc-Schalldämpfer, Negativregler und Polycomb-Response), aber darauf können wir nicht eingehen).

Ein Beispiel ist das regulatorische Element im klassischen Lac-Operon.

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Gene Silencing, wie Sie es nennen, ist epigenetischer Natur. Ich verweise Sie auf das Wiki, da es ziemlich groß und vielfältig ist, um es hier zu erklären: http://en.wikipedia.org/wiki/Gene_silencing

Sie können hier mehr darüber lesen: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26872/

Nie von NRE gehört; Was ist es? ist PRE Polycomb Response Element? oder ist es negativ reguliert und positiv reguliert. Bitte erweitern Sie die Abkürzungen. Außerdem ist lac operon kein Beispiel für einen "Silencer". Es handelt sich lediglich um eine einfache transkriptionelle Repression. Silencer wirken wie Enhancer aus großer Entfernung und haben globalere Wirkungen, aber sie wirken entgegengesetzt zu Enhancern, dh sie reduzieren die Transkriptionsaktivität.
@WYSIWYG Enthält das Lac-Operon nicht ein regulatorisches Element, das es normalerweise fernhält (LacI)? Auch den Beitrag für die Akronyme bearbeitet.
Ja, es hat ein regulatorisches Element am Promotor, das von LacI gebunden wird. Dies sind übliche cis-Elemente und werden häufig als Operatoren bezeichnet; sie betreffen nur das proximale Gen. Enhancer und Silencer kontrollieren einen größeren Abschnitt des Chromatins, der viele Gene enthalten kann, und sie interagieren manchmal auch mit Promotoren über DNA-Looping.
@WYSIWYG Interessant. Ich habe noch nie davon gehört, dass es Operator genannt wird (wurde mir nie so beigebracht), aber das ist ein Begriff. Wenn Sie sagen, dass Enhancer und Silencer einen größeren Teil des Chromatins kontrollieren, gehe ich davon aus, dass Sie sagen, dass die Enhancer nicht genspezifisch sind, richtig (in diesem Fall verstehe ich und)? Oder wollen Sie sagen, dass Enhancer und Silencers auch Chromatin-Sekundärstrukturen kontrollieren (ich habe das nicht wirklich nachgeschlagen)?
Enhancer und Silencer regulieren mehrere Gene und können mit ihren Promotoren interagieren, epigenetische Veränderungen verursachen oder beides. Beide Prozesse führen zu einer Veränderung der Chromatinstruktur.
@WYSIWYG Danke für die Klarstellung. Haben Sie eine Referenz für Enhancer/Silencer, die die Epigenetik verändern? Das würde ich sehr gerne nachlesen. Ich weiß, dass die Epigenetik Enhancer abdecken oder aufdecken kann, aber ich habe noch nie davon gehört, dass es andersherum gemacht wird.
Viele Polycomb/Trithorax-Responsive-Elemente fungieren als Enhancer (so habe ich sie anfangs kennengelernt). Andere Beispiele sind CTCF, CEBPs usw. Sie können viele gute Übersichten zu diesen Proteinen finden.
CEBP vermittelt keine epigenetischen Modifikationen, aber die anderen, die ich erwähnt habe, tun dies.
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