In Eukaryoten können microRNAs und kleine interferierende RNAs als Teil von Proteinkomplexen spezifische Boten-RNAs mit komplementären Sequenzen angreifen und dadurch die Translation hemmen. RNA kann jedoch auch DNA komplementieren. Binden regulatorische RNAs also direkt an DNA (mit einem Proteinkomplex oder alleine)?
Ich interessiere mich nur für die Regulierung, nicht für die Modifikation der DNA (wie es CRISPR tut). Ich nehme an, das bedeutet, dass ich frage, ob regulatorische RNAs dauerhaft an DNA binden und RNA-Polymerasen blockieren?
Diese Frage gilt für Eukaryoten und/oder Prokaryoten.
Ja, es gibt Berichte über RNA, die die Transkription direkt hemmt.
RNA-induzierte Transkriptions-Silencing (RITS) ist ein bekannter Weg in Schizosaccharomyces pombe (Spalthefe). Die anfängliche Heterochromatinisierung ist abhängig von der RNA (als DNA-Identifikationsmodul), die andere funktionelle Proteine zum Ziel führt (siehe auch Djupedal et al., 2009 ).
Es ist bekannt, dass piRNA in höheren Eukaryoten eine Methylierung von Ziel-DNA-Regionen und dadurch die Repression von Genen an diesen Loci verursacht ( Aravin und Bourc'his, 2008 ).
Es ist auch bekannt, dass einige Klassen kleiner RNAs in C.elegans (wie 22G-RNA) transkriptionelles Silencing verursachen.
Von vielen lncRNAs ist bekannt, dass sie die Transkription ihrer Zielgene hemmen. Das bekannteste Beispiel wäre das von XIST , das ein epigenetisches Silencing eines der X-Chromosomen bei der Frau verursacht.
Rein biochemisch können RNAs auch Triplex mit Ziel-DNA-Regionen bilden und die Transkription und Replikation behindern ( Bacolla et al., 2015 ).