Ich würde gerne wissen, was der Unterschied zwischen cis-regulierenden Elementen und DNase I-hypersensitiven Stellen ist, um eine sinnvolle Trennung von nicht codierenden Elementen zu erreichen, die die Genexpression beeinflussen.
Cis -regulatorische Elemente sind einfach DNA-Regionen stromaufwärts oder stromabwärts eines Gens, die dessen Expression beeinflussen können (im Grunde müssen sie sich im selben Chromosom befinden).
DNAse-I hypersensitive Stellen (DHS) sind Regionen des Chromatins, die während der DNAse-Behandlung verdaut werden, weil sie exponiert sind, dh nicht durch ein Protein (Komplex) geschützt sind. Der Proteinkomplex kann entweder ein Nukleosom oder ein Transkriptionsfaktor sein. Es sollte beachtet werden, dass eine DNA-Region auch aufgrund ihrer Konformation DNAse-unempfindlich sein kann.
Üblicherweise üben die cis -regulatorischen Elemente ihre Wirkung aus, indem sie als Bindungsstelle für Transkriptionsfaktoren (oder Chromatin-Remodeler) dienen. Wenn die Proteine an diesen Stellen binden, werden diese Regionen vor DNAse-Verdau geschützt, wodurch sie nicht zu -DHS werden. Es ist jedoch bekannt, dass DNA-Elemente auch in trans wirken können (siehe Artikel über die Erfassung der 3C-Chromosom-Konformation und ihrer Varianten). Außerdem sagt die Tatsache, ob eine Stelle vor DNAse geschützt ist oder nicht, nichts über ihre Funktion aus.
ein weiterer 'Homo sapien'