Werden einige nicht-kodierende RNA gespleißt?

Sie sollten sich Howald C. et al . ^{[1] ansehen} . Dies ist eine der vielen neueren Arbeiten, die mit den ENCODE-Daten verknüpft sind . Sie haben RT-PCR verwendet, um Exon-Exon-Verbindungen zu amplifizieren, und dann die Ergebnisse sequenziert. Ergänzende Tabelle 2 zeigt 3076 validierte Exon-Exon-Verbindungen in mutmaßlich verarbeiteten Transkripten, die im Hauptteil des Papiers unterklassifiziert werden können als:

Nichtkodierend, 3prime_overlapping_ncrna, Ambiguous_orf, Antisense, LincRNA, ncRNA_host, Retained_intron, Sense_intronic, Sense_overlapping, Processed Transcript.

1. Howald C, Tanzer A, Chrast J, Kokocinski F, Derrien T, Walters N, Gonzalez JM, Frankish A, Aken BL, Hourlier T, Vogel JH, White S, Searle S, Harrow J, Hubbard TJ, Guigó R, Reymond A . 2012. Kombination von RT-PCR-seq und RNA-seq zur Katalogisierung aller im menschlichen Genom kodierten genetischen Elemente. Genome Research, 22: 1698–1710, doi:10.1101/gr.134478.111 .

Nennen Sie ribosomale RNA nicht-codierend? rRNA wird sowohl in Prokaryoten als auch in Eukaryoten gespleißt.

Ja, sehen Sie sich HOTAIR (beim Menschen) sowie Cyrano und Megamind beim Zebrafisch an – sie sind alle gespleißt.