Humangenetische Vielfalt in Afrika im Vergleich zum Rest der Welt

Hintergrund

Der Anspruch ...

Der größte Teil der genetischen Vielfalt des Menschen befindet sich in Afrika

... ist durchaus üblich. Auf Biology.SE ist es einfach, Beiträge zu finden, die diese Behauptung aufstellen. Betrachten Sie zum Beispiel:

Frage

  • Ist die Behauptung wahr?
  • Welcher Anteil der gesamten genetischen Vielfalt ist in Afrika vorhanden?

Ich verstehe, dass der Begriff genetische Vielfalt oft in einem vagen Sinn verwendet wird. Bitte erläutern Sie unbedingt, welche Statistiken in der Studie berücksichtigt wurden, auf die Sie sich beziehen würden, wenn Sie Schätzungen darüber abgeben, welcher Anteil der genetischen Vielfalt in Afrika vorkommt. Beachten Sie, dass ich nicht frage: "Warum ist es wahr?" aber nur "ist es wahr"?

Ich würde gerne die Quelle für diese Behauptung wissen. Mein Geld ist darauf, dass es nicht wahr ist.

Antworten (3)

Hier ist ein Baum, der auf mitochondrialen DNA-Variationen in menschlichen Populationen basiert.

van Oven M., Kayser M. Hum Mutat. 2009 Feb;30(2):E386-94. Aktualisierter umfassender phylogenetischer Baum der globalen menschlichen mitochondrialen DNA-Variation.

menschliche Haplogruppen

Betrachtet man die genetische Distanz zwischen Populationen über Mitochondrien-DNA, so stammen alle Nichtafrikaner von einem Gründer in einer mtDNA-Gruppe (L3) ab. Alle anderen L-Gruppen sind afrikanische Populationen: L0 sind die San, L1 sind Mbenga-Pygmäen, L5 sind Mbuti-Pygmäen und die anderen sind andere afrikanische Gruppen.

Wenn man davon ausgeht, dass jede L-Haplogruppe eine genetische Variation darstellt, dann stammen 5/6 (83%) der menschlichen genetischen Variation von afrikanischen Populationen.

Aus einer anderen Quelle, die die Genetik anders betrachtet Eine Karte der Variation des menschlichen Genoms aus der Sequenzierung der Natur im Populationsmaßstab. 28. Okt. 2010; 467 (7319): 1061–1073

Populationen mit afrikanischen Vorfahren trugen die größte Anzahl an Varianten bei und enthielten den höchsten Anteil an neuartigen Varianten, was die größere Vielfalt in afrikanischen Populationen widerspiegelt. Beispielsweise wurden 63 % der neuartigen SNPs im Low-Coverage-Projekt und 76 % im Exon-Projekt in afrikanischen Populationen entdeckt, verglichen mit 20 % bzw. 33 % in den europäischen Abstammungspopulationen für die Exon- bzw. Low-Coverage-Projekte.

Ich habe zwei Artikel gefunden, die einige Informationen dazu enthalten, aber keine endgültige Antwort.

Das 1000 Genomes Project Consortium (2015) analysierte ganze Genome und stellte fest, dass „28 % der neuartigen Varianten“ bei afrikanischen Individuen gefunden wurden. Neuartige Varianten waren meistens (> 99,9 %) Einzelnukleotid-Polymorphismen oder kurze Indels. Diese Tabelle enthält alle Varianten . Allerdings waren 26 % der Genome Afrikaner, während Afrikaner etwa 16 % der Weltbevölkerung ausmachen, sodass diese Zahlen nicht auf die ganze Welt hochgerechnet werden können. Ein weiteres Problem besteht darin, dass die Proben nicht von geografisch verstreuten Personen entnommen wurden (Abbildung 1).

Anteil der genetischen Variationen, die in verschiedenen Populationen geteilt werden Abbildung 1. Anteil genetischer Variationen, die in verschiedenen Populationen geteilt werden.

Beweise für eine größere afrikanische genetische Vielfalt werden von Stephens et al. (2001) vorgelegt , obwohl sie Nordamerikaner aus verschiedenen ethnischen Gruppen betrachten, was nicht ideal ist. Sie fanden viel mehr einzigartige SNPs bei Afroamerikanern als bei anderen ethnischen Gruppen.

SNPs bei Amerikanern verschiedener ethnischer Gruppen. Abbildung 2. SNPs bei Amerikanern verschiedener ethnischer Gruppen. Bevölkerungscodes sind AF, Afroamerikaner; AS, asiatisch; CA, kaukasisch; und HL, Spanisch-Latino.

Ich konnte in der Literatur keine Behauptung finden, dass die meisten menschlichen genetischen Variationen in Afrika existieren, obwohl Afrika als eine hohe genetische Vielfalt charakterisiert wird, z . B. hier . Ich bin mir sicher, dass ich diese Behauptung außerhalb von Stackexchange gehört habe.

Meine Überprüfung der Literatur ist definitiv nicht umfassend, wenn also jemand etwas anderes findet, kann er es gerne hinzufügen.

Danke das war schon mal hilfreich. Ich musste die Originalarbeit überprüfen, um sicherzustellen, dass diese seltsame 3D-Grafik, die Excel ähnelt, tatsächlich aus einer Fachzeitschrift stammt (Zeitschrift: Science)!

Zwei neue Studien, das Ergebnis des Humangenomprojekts, untersuchten die genetische Vielfalt von über 1.000 Individuen aus 51 Bevölkerungsgruppen auf der ganzen Welt.6, 7 Wie in früheren Studien waren die Völker Afrikas genetisch am vielfältigsten. Diese Studien stellten jedoch auch fest, dass diejenigen aus dem Nahen Osten genetisch am zweithäufigsten waren. schwer zu interpretieren

http://www.godandscience.org/apologetics/humans_out_of_africa.html

Ich denke, es bedeutet, dass Afrika 150.000-500.000 Jahre menschliches Erbe in einer breiten Bevölkerungsbasis enthält, während die Basis für den Rest der Welt schmaler ist ... genauso, als ob Sie 10 Katzenfarben in einem Gehege hätten, und nur 3 Katzenfarben zogen in den Park auf der anderen Straßenseite und brüteten dort.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4067985/

In Übereinstimmung mit dem „Out of Africa“-Modell des modernen menschlichen Ursprungs weisen Analysen genetischer Daten darauf hin, dass Afrikaner eine höhere genetische Vielfalt aufweisen als Nicht-Afrikaner (Cann et al. 1987, 2002; Tishkoff et al. 1998; Marth et al. 2004).