Angenommen, ich habe zwei Proteine, Protein A und Protein B, und nehme an, dass die Sequenz der Aminosäuren von Protein B genau umgekehrt zur Sequenz von Protein A ist.
Zum Beispiel (das sind erfundene Proteine):
protein A = [G,A,L,G,M,F,R]
protein B = [R,F,M,G,L,A,G]
Wird die 3D-Struktur von Protein B irgendwie identisch oder vielleicht das Spiegelbild der 3D-Struktur von Protein A sein?
NEIN! Obwohl es eine Beziehung gibt, würde sich das Protein nicht richtig falten, da die C- und N-Terminals vertauscht sind. Beachten Sie Folgendes:
H(NH)-AC(=O)(NH)-BC(=O)(NH)-CC(=O)(NH)-DC(=O)(NH)-E-(C=O)OH
in Anlehnung an:
HO(C=O)-A-(NH)(C=O)-B-(NH)(C=O)-C-(NH)(C=O)-D-(NH)(C=O) -E-(NH)H
Das sind ganz andere Moleküle!
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1604320 http://www.pnas.org/content/95/13/7287.long http://www.pnas.org/content/111/ 32/11679
A. Radek Martínez
David
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Lior
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