Welcher Anteil an Proteinen erfordert eine Chaperon-unterstützte Faltung?

Ich bin neu auf dem Gebiet der Biochemie (eigentlich bin ich Chemiker).

Ich kenne den Vorgang der Faltung seit langem als den Vorgang, der zur minimalen Energiekonformation eines Proteins führt.

Jetzt werde ich den Begleitern vorgestellt, die ich vorher nicht kannte.

Was ich mich frage, ist: Meine frühere Ansicht der Faltung als Prozess der "Selbstmontage" (das Protein faltet sich ohne externe Hilfe, wenn es vom Ribosom zusammengesetzt wird) ist real, oder wird jeder Faltungsprozess von Chaperonen unterstützt?

Wenn beide Prozesse vorhanden sind, wie häufig ist die "unterstützte" Faltung im Vergleich zum spontanen Prozess?

Ich habe Ihren Titel bearbeitet, um das Wort "häufig" zu entfernen, da das, was Sie fragen, keine zeitliche Frage ist (wie viele Proteine ​​​​pro Minute mit Chaperonen gefaltet werden), sondern eine Frage des Verhältnisses oder der Beschreibung (sind alle Proteine ​​nur eine gewisse Falte). Weg). Setzen Sie sie zurück oder ändern Sie sie, wenn Ihnen meine Änderung nicht gefällt.

Antworten (1)

Ich erinnere mich an eine schöne Rezension in Trends in Biochemical Sciences , in der es um Chaperon-unabhängige, teilweise abhängige und vollständig abhängige Proteine ​​in Prokaryoten geht. Die Schlussfolgerung war, dass kleinere Polypeptide mit geringerer Wahrscheinlichkeit eine Begleitperson benötigen. Das ist ihre Figur:

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Dieses Prinzip gilt immer noch bis zu einem gewissen Grad (in Prokaryoten), aber die Unterstützung der Faltung wird jetzt allgemein so verstanden , dass sie viel mehr umfasst als nur spezifische Proteine, die als molekulare Chaperone identifiziert wurden. Das Anfinsen-Postulat (dass die endgültige Tertiärstruktur eines Proteins nur von seiner Primärstruktur abhängt) mag immer noch für kleine kugelförmige Proteine ​​gelten, aber die Faltung in vivo wird mit ziemlicher Sicherheit immer unterstützt. Da Sie aus der Sicht eines Chemikers kommen, stellen Sie es sich nicht als Reaktion zwischen zwei Molekülen in Lösung vor. Es ist eine Reaktion in einem Gel, das mit komplexen Zuckern, Lipiden, Proteinen und Nukleinsäuren gefüllt ist.

Wenn Sie der Perspektive eines überfüllten Zytoplasmas skeptisch gegenüberstehen, lesen Sie die von mir verlinkte Rezension. Es ist ein wichtiger, aber oft unterschätzter Aspekt der In-vivo-Biochemie. Es gibt noch viel mehr darüber zu lesen. Sie könnten versuchen, Allen Minton (AP Minton) und makromolekulares Crowding in Ihrer bevorzugten Datenbank nachzuschlagen.

Ich würde Ihre Antwort positiv bewerten, aber für die letzten beiden Sätze. Wenn das Zytoplasma "ein Gel ist, das vollständig mit Dingen gefüllt ist", wie diffundieren tRNAs, Proteinsynthesefaktoren usw. zu den Ribosomen und verteilen sich die freigesetzten Proteine ​​im Zytoplasma? Und was hat das genau mit der Proteinfaltung zu tun? Das ist eine ernsthafte, keine rhetorische Frage.
@ David hast du das ernsthafte, nicht rhetorische Papier gelesen, auf das ich verwiesen habe?
@David beim erneuten Lesen habe ich es vielleicht etwas stärker formuliert, als ich hätte tun sollen, um den Unterschied zwischen verdünnter In-vitro-Biochemie und der gelartigen Phase hervorzuheben, in der Proteinbiochemie (einschließlich Faltung) in vivo stattfindet. Ich habe das Wort komplett entfernt und einen Kommentar dazu hinzugefügt.
— Ich werde Ihre Referenz überprüfen. Ich reise in ein fremdes Land, wo mir 7 £ pro Mb für Daten berechnet werden, also bin ich auf einen ziemlich flockigen WLAN-Empfang angewiesen.
Ok, ich habe mir sowohl die TIBS-Rezension als auch die 2012 Int J Mol Sci-Rezension angesehen. Ich sehe, dass Letzterer darauf hinweist, dass die Ergebnisse in vitro nicht immer von denen in vitro bestätigt werden (z. B. mit Mutanten in den Chaperonen), und die Autoren schlagen vor, dass (unspezifische?) Wechselwirkungen mit anderen Molekülen wichtig sein könnten. Das ist alles, was ich sehe, was sich auf Ihre "Gel" -Bemerkung bezieht, die Sie, wie ich jetzt sehe, in Ihrer Antwort klargestellt haben. Der allgemeine Eindruck, den ich bekomme, ist, dass es schwierig ist, die gestellte Frage genau zu beantworten, obwohl es sicherlich eine unterstützte Faltung gibt.
@David sie überprüfen die vielen Beweise für die Bedeutung anderer Makromoleküle bei der Faltungsunterstützung. Sie scheinen nicht überzeugt zu sein :) Lesen Sie einige Arbeiten von Allen Minton.
Ich zweifle nicht an der Rolle anderer Moleküle bei der Faltung. Es scheint mir nur aus der Rezension, dass das Feld noch im Fluss ist. Das ist keine Kritik, nur ein Eindruck.
Welcher Anteil an Proteinen erfordert eine Chaperon-unterstützte Faltung?
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