Während ich die Arbeit mit dem Titel „GEOMETRIC ANALYSIS OF THE CONFORMATIONAL FEATURES OF PROTEIN STRUCTURES“ von Manish Dutt durchging, erfuhr ich, dass es eine Korrelation zwischen dem Gyrationsradius und der Anzahl der Schichten der konvexen Hülle jeder 3D-Struktur des Proteins (convex Hüllenschichten werden gebildet, indem die konvexe Hülle einer Menge von Punkten gebildet wird, die die erste Schicht bildet, sie dann entfernt und eine andere Menge von Grenzpunkten neu berechnet wird, ii, zweite konvexe Hülle, die die zweite Schicht bildet).
Meine Frage ist nun, was ist die biologische Bedeutung dieser Korrelation? Oder gibt es welche?
Wenn ich die Zeitung lese, sehe ich keine offensichtliche biologische Bedeutung. Die Zusammenfassung sagt:
Proteine weisen eine faszinierende Vielfalt in ihren dreidimensionalen Konformationen auf, die es ihnen ermöglicht, unterschiedliche Funktionen zu erfüllen
Das ist großartig, aber es gibt in diesem Artikel keinen Zusammenhang zwischen Konformation und Funktion - nicht überraschend, da dies ein großer Teil der strukturellen Proteinanalyse ist!
Die Art und Weise, wie ich diese Arbeit betrachte, ähnelt der Idee eines "Deskriptors" aus dem Bereich der Cheminformatik. Der Gyrationsradius ist ein Deskriptor, ebenso wie diese Rumpfnummer. Der Autor behauptet eine Korrelation zwischen diesen beiden Deskriptoren, also ... ist einer einfacher zu berechnen als der andere?
Dies ist eine interessante Arbeit, aber ich bin mir an dieser Stelle nicht sicher, welche Bedeutung die Hüllennummer für die Proteinstrukturanalyse hat. Ich kann jedoch sagen, dass die Korrelation zwischen diesen beiden Deskriptoren biologisch nicht signifikant ist - es ist nur eine geometrische Beziehung, die vermutlich für jeden Satz von 3D-Punkten gelten würde.
gilleain
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Mädchen101