Ich bin kein Biologe, also ertragen Sie mich bitte für diese grundlegende Frage. Obwohl ich versucht habe zu googeln, bin ich verwirrt.
Was ist der Unterschied zwischen Plastiden, Chloroplasten und Mitochondrien?
Plastid ist ein allgemeiner Begriff für eine Organelle, die aus Chloroplasten, Chromoplasten, Leukoplasten/Amyloplasten und Apicoplasten besteht.
Chloroplasten ( Chloro = grün ) sind an der Photosynthese beteiligt; sie exprimieren Chlorophylle und haben die Thylakoidstrukturen, die an der Elektronentransportkette beteiligt sind, die während der Lichtreaktionen der Photosynthese zur ATP-Bildung führt. Wie es offensichtlich ist, befinden sich Chloroplasten in den grünen Teilen der Pflanzen wie Blättern. Chloroplasten haben auch die Enzyme von Biosynthesewegen, die an der Kohlenstofffixierung beteiligt sind.
Chromoplasten ( Chromo = farbig ) exprimieren mehr andere Pigmente und weniger Chlorophyll. Sie haben auch keine Thylakoidstrukturen. Daher sind sie nicht an der Photosynthese beteiligt. Wenn Früchte reifen, differenzieren sich die Chloroplasten zu Chromoplasten. Blumen enthalten auch viele Chromoplasten.
Leukoplasten ( Leuko = weiß ) besitzen keine Farbstoffe und führen in der Regel biosynthetische Prozesse durch. Wenn sie Stärke speichern, werden sie Amyloplasten genannt.
Apicoplasten kommen in Parasiten wie Plasmodien vor (verursacht Malaria) und sind für ihr Überleben lebenswichtig. Der Apicoplast ist an Biosynthesewegen beteiligt, aber seine genaue Bedeutung bleibt unbekannt.
Das Mitochondrium ist ein ganz anderes Organell und hat einen anderen evolutionären Ursprung. Mitochondrien produzieren wie Chloroplasten ATP aus einer Elektronentransportkette, verwenden jedoch chemische Substrate (NADH, Flavin usw.) anstelle von Licht als Quelle für anfängliche Energie. Es wird angenommen, dass Mitochondrien das Ergebnis einer Endosymbiose zwischen einer eukaryotischen Vorfahrenzelle und einer -Proteobakterium. Chloroplasten hingegen stammen von einem Cyanobakterien-Endosymbionten ab. Daher unterscheidet sich die Struktur der Mitochondrien stark von der der Chloroplasten.
Chromoplasten, Leukoplasten, Amyloplasten und Apicoplasten haben die photosynthetische Fähigkeit verloren. In ähnlicher Weise gibt es Varianten von Mitochondrien, die andere Elektronenakzeptoren (außer Sauerstoff) verwenden, und einige sind einfach nicht in der Lage, ATP zu synthetisieren.
Gibt es für jeden von ihnen (Plastiden, Chloroplasten und Mitochondrien) eine Pflanzensequenzdatenbank?
Chloroplasten-Genomdatenbank: {link}
Ich kenne keine separate Pflanzen-Mitochondrien-Datenbank, aber Sie können diese Ressource namens MitBASE sehen .
NCBI hat auch die organellären DNA-Sequenzen.
Können wir Chloroplasten, Mitochondrien, Plaidsequenzen von der gesamten Genomanordnung trennen?
Normalerweise werden die Organellengenome als separate Contigs zusammengesetzt, wenn Sie aus der DNA-Präparation der ganzen Zelle sequenzieren. Durch Homologie ist es möglich zu sagen, ob das Contig eine Mitochondrien- oder Chloroplasten-DNA ist. Aber der beste Weg wäre, die Organellen experimentell zu isolieren und ihre DNA zu sequenzieren.