Spielt die komplementäre Basenpaarung der rRNA mit sich selbst eine Rolle bei ihrer Transkription?

Ich habe gelesen, dass die Termination der Transkription von mRNA eine Terminationssequenz in Form einer Stammschleife umfasst. Da die Struktur der ribosomalen RNA eine umfangreiche interne Basenpaarung beinhaltet, frage ich mich, ob ein Teil der reifen rRNA die Terminationsschleife für ihre Transkription bereitstellt.

Deine Frage ist mir unklar. Ihre Frage scheint sich auf die Beendigung der Transkription von rRNA zu beziehen, obwohl Ihr Titel sich auf die rRNA-Struktur zu beziehen scheint, die aus jedem Buch oder Wikipedia beantwortet werden kann. Ihr Tag der umgekehrten Transkription war sicherlich falsch und ich habe ihn entfernt. Bitte klären Sie Ihre Frage, aber lesen Sie zuerst etwas. Eine Aussage, dass „Ich weiß, dass rRNA von einem Gen stammen muss“, legt nahe, dass Sie davon profitieren könnten.
Da Sie nicht geantwortet haben und niemand meiner Abstimmung zum Schließen dieser Frage gefolgt ist, habe ich sie so umgeschrieben, dass sie jetzt einen Sinn ergibt und möglicherweise das ist, was Sie gemeint haben. Wenn nicht, bitte bearbeiten. Ich habe meine enge Abstimmung rückgängig gemacht und werde die Frage beantworten, wenn es sonst niemand tut.

Antworten (2)

Zusammenfassung

Der Prozess der Beendigung der Transkription ist noch nicht gut verstanden. Es unterscheidet zwischen Eukaryoten und Prokaryoten und zwischen mRNA und rRNA. Obwohl es sich um Stamm-Schleifen-Strukturen handelt, können solche Strukturen notwendig sein, reichen aber nicht für die Terminierung aus. Die Vorstellung, dass das Terminationssignal Teil des reifen funktionellen Transkripts sein könnte – insbesondere bei rRNA – stößt auf eine Reihe von Problemen und erweist sich als falsch. Zu diesen Problemen gehören die ausgedehnte Natur der Stammschleifen (welche zu verwenden?) und die Tatsache, dass die kleineren Stammschleifen, die aus dem kernkonservierten wasserstoffgebundenen Skelett hervorgehen, nicht unbedingt selbst konserviert sind (Übersicht von Brimacombe). Tatsächlich befinden sich die großen und kleinen rRNAs in einer einzigen Transkriptionseinheit mit anderen Genen, an deren Ende spezifische Terminationssignale außerhalb der Region stehen, die die reife rRNA codiert.

Prokaryotische rRNA-Transkription

Dies wurde von Condon, Squires and Squires (1995) rezensiert . Die Struktur des gut untersuchten rrnB- Operons von E. coli ist unten gezeigt, wobei die Promotoren als 'P 1 ' und P 2 ' und die Terminatorsequenzen als 'T 1 ' und 'T 2 ' angegeben sind. (Nach Pfeiffer und Hartmann übernommen .)

Struktur des rrnB-Operons

Diese Transkriptionseinheit umfasst die 5S-rRNA sowie eine tRNA.

Eukaryotische rRNA-Transkription

Dies wurde von Goodfellow und Zoomerdijk (2012) überprüft , aus denen das folgende Diagramm der Säugetier-rDNA-Wiederholung stammt. Die Abschlusselemente sind „T 1–10 “.

eukaryontische ribosomale DNA-Wiederholung

In Eukaryoten befindet sich die 5S-rRNA nicht in derselben Transkriptionseinheit wie die großen und kleinen rRNAs (und die 5.8S-rRNA). Tatsächlich wird es von der DNA-abhängigen RNA-Polymerase III transkribiert und nicht von der DNA-abhängigen RNA-Polymerase I, die die gezeigte rDNA-Wiederholung transkribiert.

Transfer-RNAs (rRNAs), ribosomale RNAs (rRNAs) falten sich alle auf sich selbst zurück und bilden Wasserstoffbrücken, um komplementäre Basenpaare zu bilden. Also ja, das ist üblich.

Ich denke, dass sich die Frage trotz des Titels auf die Beendigung der rRNA-Transkription und nicht auf die rRNA-Struktur bezieht. Wenn er darüber nachdenkt, fragt er wahrscheinlich, ob die Transkriptionsterminationsschleife (falls eine solche für rRNA existiert – ich weiß es nicht) Teil des rRNA-Transkripts und (vielleicht) der reifen prozessierten rRNA ist.
Entschuldigung, aber ich habe die Frage so bearbeitet, dass Ihre Antwort nicht mehr relevant ist. Da es nur ein Zweizeiler ist, hoffe ich, dass es Sie nicht zu sehr belästigen wird.