Wie wird die Transkriptionsrichtung der RNA-Polymerase bestimmt?

Wenn Transkriptionsfaktoren an den DNA-Strang anlagern - Woher wissen sie, in welche Richtung sie die Transkription durch die RNA-Polymerase initialisieren müssen? Wird es sowieso immer in die gleiche Richtung gelesen? Was ist mit diesen „Promotoren“? Beeinflussen sie die Transkriptionsrichtung?

Meinen Sie mit Richtung, welcher der beiden DNA-Stränge transkribiert wird? Oder meinen Sie, ob die Polymerase auf einem Einzelstrang von 5' nach 3' oder von 3' nach 5' geht?
@MadScientist Obwohl die erste Frage auch interessant ist, interessiert mich die zweite im Moment.

Antworten (1)

Die Transkription verläuft immer in Richtung 5' (5-Strich) nach 3' (3-Strich) auf dem codierenden DNA-Strang. Die Bindung sowohl von Transkriptionsfaktoren als auch von RNA-Polymerase an DNA hängt von Sequenzmotiven in der DNA ab. Die Transkription erfolgt in Bezug auf die chemische Struktur des kodierenden DNA-Strangs immer in die gleiche Richtung, während die Transkriptionsrichtung in Bezug auf die Struktur des Chromosoms davon abhängt, auf welchem ​​​​Strang sich die kodierende Sequenz befindet (und somit welcher Strang als definiert wird). kodierender Strang für dieses Gen).

Nur zur Verdeutlichung: RNAP bewegt sich relativ zum Matrizenstrang von 3' nach 5'. Das Transkript wird von 5' nach 3' polymerisiert und hat dieselbe Sequenz wie der codierende Strang (außer U anstelle von T).
Danke, guter Punkt. Der gesamte Prozess wird mit Zahlen in einem NCBI-Online-Buch hier beschrieben: ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22085
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Ich glaube nicht, dass die Transkription immer funktioniert 5 ' → 3 ' wrt zum codierenden Strang. Siehe en.wikipedia.org/wiki/…
In diesem Fall gibt es zwei codierende Stränge, sodass die Transkription in Bezug auf jeden codierenden Strang immer noch auf die gleiche Weise verläuft.
Was ist im negativen Sinne mit ssRNA in Viren?
Ich denke, dass es während der Replikation eine Untereinheit gab, die die Richtung gewährleistete, aber ich erinnere mich nicht, welche. Vielleicht tritt eine ähnliche Situation in der Transkription auf?
Ich denke, es ist wichtiger, hier zu verstehen, woher diese Enzyme „wissen“, was zu tun ist. Ich finde es faszinierend, dass sich die Polymerase tatsächlich rückwärts bewegen kann, um Fehlerkorrekturen durchzuführen. Woher wissen sie, dass sie das tun? Gibt es eine Art biologische Software in einem Enzym, die ihnen sagt, wie sie diese Dinge tun sollen?
user38945 "hat recht". Im Ernst: Jeder „Promotor“ ist nur ein Sandkorn im Strang, es stimmt, dass es – rechts oder links, von „jenem“ Promotor – einige Nukleotide gibt, die „seine“ Richtung, also seine Lenkung definieren. (Mit meiner Mathematik würden zwei davon ausreichen (da Polymerase ein Trickpony ist, macht es von '3 bis '5, macht es immer.))
Wie wird die Transkriptionsrichtung der RNA-Polymerase bestimmt?
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