Ich habe Probleme zu verstehen, wie Eukaryoten die Transkription beenden. Beim Studium der Campbell-Biologie (Seite 342, 10. Aufl.) las ich:
In Eukaryoten transkribiert die RNA-Polymerase II die Polyadenylierungssignalsequenz auf DNA, die ein Polyadenylierungssignal (AAUAAA) in der Prä-mRNA spezifiziert. Dies wird als "Signal" bezeichnet, da dieser Abschnitt von sechs RNA-Nukleotiden, sobald er erscheint, sofort von bestimmten Proteinen im Zellkern gebunden wird.
Der Text fährt fort mit:
Dann, an einem Punkt etwa 10–35 Nukleotide stromabwärts von der AAUAA, schneiden diese Proteine es von der Polymerase frei und setzen die Prä-mRNA frei.
Bedeutet dies, dass Prä-mRNA für 10-35 Nukleotide nach der Transkription von AAUAA weiter synthetisiert wird, bevor sie schließlich abgeschnitten wird?
Vielen Dank.
Nach Lewins Genes XI - Krebs et. al über eukaryotische Transkription, RNA-Spleißen und -Verarbeitung
Es ist nicht klar, ob die RNA-Polymerase II tatsächlich an einem Terminationsereignis an einer bestimmten Stelle beteiligt ist. Es ist möglich, dass seine Terminierung nur lose spezifiziert ist. In einigen Transkriptionseinheiten erfolgt die Termination mehr als 1000 bp stromabwärts der Stelle, entsprechend dem reifen 3'-Ende der mRNA (das durch Spaltung an einer bestimmten Sequenz erzeugt wird). Anstatt spezifische Terminatorsequenzen zu verwenden, beendet das Enzym die RNA-Synthese innerhalb mehrere Standorte, die sich in ziemlich langen "Terminatorregionen" befinden. Die Beschaffenheit der einzelnen Terminierungsstellen ist weitgehend unbekannt.
Es heißt weiter,
Die Stelle der Spaltung/Polyadenylierung in den meisten prä-mRNAs wird von zwei cis - aktiven Signalen flankiert: einem stromaufwärts gelegenen AAUAAA-Motiv, das 11 bis 30 Nukleotide von der Stelle entfernt angeordnet ist, und einem stromabwärts gelegenen U-reichen oder GU-reichen Element. Das AAUAAA wird für die Spaltung und Polyadenylierung benötigt, da die Deletion oder Mutation des AAUAAA-Hexamers die Erzeugung des polyadenylierten 3'-Endes verhindert (obwohl es in Pflanzen und Pilzen erhebliche Abweichungen vom AAUAAA-Motiv geben kann).
Ich sollte hinzufügen, dass die Bedeutung von 11 bis 30 oder, wie Sie sagten, 10 bis 35 Nukleotiden darin besteht, dass es Ihnen die ungefähre Größe des Proteinkomplexes mitteilt, der auf der RNA sitzt, und wo sich die aktive Stelle des Proteins befindet. Die Domäne, die die Terminationssequenz erkennt, ist etwa 10 bis 35 Basen breit. Es ist wahrscheinlich, dass die Variation auf die Fähigkeit der RNA-Sequenz nach der Terminationssequenz zurückzuführen ist, eine Stammschleifenstruktur zu bilden.
Campbell nimmt einen notwendigerweise grundlegenden und weniger nuancierten Zugang zu den Informationen, die sie zur Molekularbiologie bereitstellen. Der Ansatz besteht darin, einige Details bereitzustellen und die evolutionären Gemeinsamkeiten zwischen einer Vielzahl von biologischen Systemen aufzuzeigen. Der Ansatz ist in Ordnung, da er Sie dazu bringt, über die Vernetzung biologischer Systeme nachzudenken.
Im Laufe Ihres Studiums werden Sie feststellen, dass die Realität und die Besonderheiten weitaus komplexer und auf Ausnahmen basierender sind, als dies in den Einführungskursen dargestellt wurde. Aber die fortgeschritteneren Kurse verbringen ein ganzes Semester damit, sich auf das zu konzentrieren, was Campbell in einem Kapitel behandelt. Campbell ist genau, aber aus Notwendigkeit unvollständig.