Ich interessiere mich derzeit für Algentaxonomie (ich bin kein Experte auf diesem Gebiet).
Ich habe die Taxonomie meiner Sequenzen mit ihrer NCBI-Zugangsnummer über die Taxonkit-Software ( https://bioinf.shenwei.me/taxonkit/usage/ ) abgerufen.
Mir ist aufgefallen, dass ich Cryptophyta auf Klassenrangebene erhalte.
Für mich entspricht -phyta eigentlich eher dem Stammesrang.
Ich habe auf der NCBI-Site nachgesehen und bin tatsächlich ordentlich im Klassenrang ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=3027&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock ) aber beispielsweise wird Cryptophyta in der Algaebase-Datenbank ( http://www.algaebase.org/browse/taxonomy/detail/?taxonid=Xafa8c1d30aa53593 ) als Phylum.
Können Sie mir sagen, warum Cryptophyta bei NCBI auf Klassenebene und nicht auf Phylum-Ebene rangiert?
Umgekehrt rufe ich die Taxonomie beispielsweise mit Phaeophyceae auf Phylum-Ebene ab ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=2870&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode= 1 & unlock ), während es normalerweise eine Klasse auf Algaebase ist ( http://www.algaebase.org/browse/taxonomy/detail/?taxonid=L8055ac0a94735f3e ).
Haben Sie Ideen, die berücksichtigt werden? Ich bin sehr interessiert !
Vielen Dank im Voraus für Ihre Antworten.
Mit freundlichen Grüßen
Es ist nicht möglich zu sagen, welches „richtig“ und welches „falsch“ ist; Tatsächlich ist das "Ranking" selbst ein größeres Problem mit dem gesamten Klassifizierungssystem.
Nach dem „Konzept der sexuellen Art“ haben wir ein gewisses Verständnis dafür, dass viele (aber nicht alle) Arten auf „den gleichen Rang“ fallen; aber für überspezifische Ränge ist es theoretisch unmöglich zu sagen, ob das Gras (das als "Familien"-Rang bezeichnet wird) und ein Compositae (das als "Familien"-Rang bezeichnet wird) genau auf denselben "Rang" fallen oder nicht ; Ebenso ist es theoretisch unmöglich zu sagen, ob das Tier (angeblich Königreichsrang) und die Pflanze (angeblich Königreichsrang) genau denselben Rang haben.
Praktisch; Wir ordnen die Taxa aus verschiedenen Abstammungslinien zwangsweise ähnlichen Rängen zu, etwas basierend auf offensichtlicher Wahrnehmung, und in einigen Fällen entwickeln wir feine Einteilungen von Rängen und entwickeln einige Kriterien, die auch auf der Wahrnehmung von 1 oder einem Team von OP-Leuten basieren; aber das ist nicht absolut.
Was wir theoretisch bestätigen können, das Taxon „Pflanze“ ist sicherlich höher als (Obermenge von) dem Taxon „Gras“ (eine Untermenge). Dh Hierarchien (Obermengen-Untermengen-Beziehungen) existieren entlang einer Linie. Aber der Begriff „Rang“; dh die Zuordnung von 2 Taxa aus unterschiedlichen Linien zu "Rängen" ist höchst subjektiv und umstritten. (Ich persönlich gestehe, dass ich nicht weiß, ob das Ranking-System einen wirklichen Vorteil hat, außer Informationen zu arrangieren.)
Ein routinemäßiger Rangwechsel macht in der Regel nichts richtig oder falsch. (Wenn Sie innerhalb der einzelnen Abstammungslinie ein Phylum in eine Ordnung und gleichzeitig eine Ordnung in ein Phylum eingeordnet haben, dann wäre dies eine klare falsche oder durcheinandergebrachte Teilmengen-Obermengen-Beziehung). Aber wenn Sie nur eine vage und verwirrende Art von "Gewichtung" in Bezug auf Taxa anderer Linien ändern; alle Subset-Superset-Beziehungen unverändert lassen; eigentlich ändert sich nichts!
NB Zusätzlich, wenn ein Taxon (Satz) in benachbarte oder mehrere Taxa zerlegt wird oder 2 benachbarte Taxa (Satz) verschmolzen werden (ohne ein Taxon von einer Linie zu einer anderen zu schneiden), ist dies auch eine geringfügige Änderung der „Verfeinerung“ oder „ Auflösung", nicht eine Änderung der Korrektheit oder Unkorrektheit.
Tof
Immer verwirrt