Transkribieren von DNA in mRNA mit Introns

Ich habe ein Problem in meinem Bioinformatik-Kurs, von dem ich dachte, dass ich es richtig mache, aber jemand anderes bekommt eine andere Antwort. Hier ist das Problem:

Wenn sich bei der folgenden DNA-Sequenz 5'-GGATCGTGCCACCATCCACCATCGTTA-3' zwei Introns in den Basen 3-9 und 15-22 befinden, was ist die transkribierte mRNA? Geben Sie die Antwort 5' bis 3'. Beachten Sie, dass die erste Basis Basis 1 ist.

Und hier sind die Schritte, die ich unternommen habe:

  1. 5'-GG ATCGTGC CACCA TCCACCAT CGTTA-3' (fettgedrucktes entfernen)
  2. 5'-GGCACCACGTTA-3' (neue Zeichenfolge)
  3. umgekehrtes Komplement nehmen
  4. Ts mit Us tauschen

Ist das richtig? Oder wo liege ich falsch?

Wenn Sie auf ensembl.org schauen, was echte Biologen verwenden, sind die für ein Gen angegebene DNA-Sequenz und die für ein Transkript angegebene DNA-Sequenz gleich, wenn das Gen in Vorwärtsrichtung läuft. Sie sind nicht rev-kompensiert; Die Leute ersetzen nicht einmal U's in den Sequenzen. Denken Sie also daran, dass Sie zum Teil nur beweisen wollen, dass Sie wirklich wissen, dass RNA U's hat, dass es einen Unterschied zwischen Template und kodierenden Strängen gibt ... echte Biologen halten das für selbstverständlich

Antworten (1)

Ich denke, der einzige Ort, an dem Sie falsch liegen, besteht darin, sich über Stränge zu verwirren ("Nehmen Sie umgekehrte Ergänzung").

5'-GGATCGTGCCACCATCCACCATCGTTA-3'   << coding strand
3'-CCTAGCACGGTGGTAGGTGGTAGCAAT-5'   << template strand

Der codierende Strang hat die gleiche Sequenz wie die transkribierte RNA (abgesehen von T>U), daher ist das primäre Transkript:

5'-GGAUCGUGCCACCAUCCACCAUCGUUA

Dann Positionen der Introns:

5'-GG AUCGUGC CACCA UCCACCAU CGUUA

und nach dem spleißen:

5'-GGCACCACGUUA
Nehmen Sie nach dem Spleißen das umgekehrte Komplement? Es sieht so aus, als hätten wir das gleiche Ergebnis erhalten, ich habe nur die umgekehrte Ergänzung genommen und die Ts zum letzten U umgedreht
Sie müssen nicht das umgekehrte Komplement nehmen - der „obere“ Strang der DNA (dh die Sequenz in Ihrer Frage) ist dieselbe Sequenz wie die RNA, da die RNA unter Verwendung des komplementären Strangs als Vorlage hergestellt wird. Ich habe den "unteren" Strang zur Verdeutlichung eingeschlossen.
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