Warum sind Thermus aquaticus und Taq Pol stabil?

Was ist die molekulare Grundlage für die Stabilität des Bakteriums Thermus aquaticus und des von ihm produzierten Enzyms Taq Pol?

Ich habe versucht, dies zu googeln, aber keine gute Antwort erhalten.

Gehört Thermus aquaticus übrigens zu den Archaeen oder zu den Bakterien? Wikipedia sagt Bakterien, aber ich habe woanders gelesen, dass es Archea ist

Antworten (1)

Hier ist ein Artikel von Razvi und Scholtz , der Ihnen hilft, die Thermostabilität thermophiler Proteine ​​zu verstehen. Sie verglichen die Proteinstabilität thermophiler Proteine ​​und ihrer homologen Versionen in mesophilen Bakterien (dh Bakterien, die in normaleren Temperaturbereichen wachsen) und stellten diese Proteine ​​in einer Datenbank zusammen. Ihre Methode bestand darin, Schätzungen der Proteinstabilitätskurven für jedes dieser Proteine ​​durch ein Modell der freien Energie vorzunehmen, das auf den bekannten physikalischen Parametern dieser Proteine ​​basiert. Aus dem Artikel:

[...] der gebräuchlichste Weg, um eine höhere [Schmelztemperatur] in Proteinen von Thermophilen zu erreichen, besteht darin, die Stabilitätskurve bei allen Temperaturen auf höhere Werte von ΔG (höhere intrinsische Stabilität) anzuheben."

Dies wird durch Mutation nur der linearen Sequenz des Proteins erreicht. Grundsätzlich,

"...jede der Stabilisierungsmethoden ist das Ergebnis von Merkmalen wie einer erhöhten Anzahl von Wasserstoffbrückenbindungen, Salzbrücken, verbesserter Kernpackung, kürzeren und/oder engeren Oberflächenschleifen, verbesserten Neigungen zur Sekundärstruktur oder Oligomerisierung."

Außerdem ordnet alles, was ich über die Gattung Thermus gesehen habe, sie als gramnegative Bakterien ein.

  1. Razvi und Scholz. Lektionen zur Stabilität von thermophilen Proteinen. Protein Science, 15(7) 2006.
Wie kann die Oligomerisierung dabei helfen?
Obwohl ich bezweifle, dass die Oligomerisierung zur Stabilisierung von Taq DNA Pol verwendet wird, kann die Oligomerisierung (normalerweise durch C- oder N-terminale Schwänze) zur Stabilisierung größerer, quaternärer Strukturen beitragen. Zum Beispiel: Hämoglobin, Insulin.
Ich weiß nur, was Oligomerisierung bedeutet. Ich kann also nicht verstehen, was es genau tut, um Proteine ​​zu stabilisieren.