Ich bin kürzlich auf die Wiki-Seite Biological Dark Matter gestoßen . Es ist ziemlich leicht in Details, aber es scheint genetisches Material zu sein, das bei Menschen gefunden wurde und nicht in die aktuellen Klassifikationen fällt.
Aber was wissen wir darüber? Ist es wirklich eine große Blackbox, von der wir nichts wissen? Der Artikel behauptet, dass es 40 % des genetischen Materials in unserem Darm ausmachen kann, und ich finde es schwer zu glauben, dass wir wirklich nichts darüber wissen.
Auf diese Frage gibt es mehrere Antworten, je nachdem, wen Sie fragen (d. h. in welchem Fachgebiet).
Die biologische dunkle Materie aus dem fraglichen Wikipedia-Artikel scheint eine Sequenz aus metagenomischen Proben zu bedeuten, die keinem unserer allgemein bekannten Bereiche des Lebens zugeordnet wurde. Das muss nicht zwangsläufig bedeuten, dass es ihnen nicht gehört. Manchmal ist es schwierig zu entscheiden, wo ein kleines Teilchen von Sequenzinformationen hingehört, weil es mit nichts übereinstimmt, was wir wissen. Trotzdem könnte es von einem vollkommen "normalen" Bakterium stammen. Oder es könnte ein Ergebnis von Sequenzierungsfehlern sein.
Je nachdem, wie Sie der Sequenz eine Taxonomie zuweisen, kann es außerdem Fälle geben, in denen es so viele verschiedene Möglichkeiten gibt, woher diese Sequenz stammt (weil sie in vielen verschiedenen Organismen, sogar aus verschiedenen Lebensbereichen, sehr konserviert ist). , dass dieser Sequenz keine Taxonomie zugewiesen wird. Nicht weil es keine gibt, sondern weil wir nicht sicher entscheiden können, welche es ist. Manche sprechen von dieser Information auch als „dunkle Materie“. Da gibt es zum Beispiel dieses Projekt , das speziell darauf ausgelegt ist, die dunkle Materie zu untersuchen, die wir Mikroben zuordnen können (oder zumindest aus irgendeinem Grund tun), aber nicht genauer.
Grundsätzlich wird jede Entscheidung, wo eine potenzielle Sequenz aus dunkler Materie platziert werden soll, von unserem bisherigen Wissen über die Bereiche des Lebens und die Genome all dieser Organismen geleitet. Dieses Wissen ist sehr unvollständig.
Es tut mir leid, dass dieser Antwort einige nettere Quellen fehlen. Die meisten Informationen basieren auf meinem Wissen als Person, die mit Datensätzen arbeitet, die "dunkle Materie" enthalten könnten, wenn ich es so nennen würde. (Ich nenne es "nicht zugewiesene Sequenz".) Ich habe jetzt keine Zeit, weitere Quellen hinzuzufügen, aber bei Bedarf kann ich vielleicht später einige hinzufügen.
Bearbeiten: Als schnelle Ergänzung nach dem erneuten Lesen Ihrer Frage: Wie viel der Sequenz zum Beispiel nicht zugeordnet ist, wenn man Ihren Darm untersuchen würde, hängt stark davon ab, was tatsächlich in Ihrem Darm vorhanden ist, von dem wir wissen, wie vielfältig die Community ist Ihr Bauch ist, welche Datenbank zum Vergleich verwendet wird und wie alt diese Datenbank ist, wie die Daten vorverarbeitet und analysiert werden und vieles mehr. Aber ja, es gibt immer noch viele genomische Informationen in der Natur, die es in keine Datenbank geschafft haben.
Schauen Sie sich diesen Artikel an: http://phys.org/news/2014-01-scientists-biological-dark.html
Ist das dieselbe "biologische dunkle Materie", nach der Sie fragen? Wenn dem so ist, dann klingt es wie das, was man früher "Junk-DNA" oder "nicht-kodierende DNA" nannte, wie es bis vor ein paar Jahren genannt wurde, als Wissenschaftler entdeckten, dass es sich tatsächlich um regulatorische DNA handelt, sehr interessantes Zeug, aber im Grunde reguliert es die Genexpression, weshalb es normalerweise in Form von RNA statt eines Proteins vorliegt. Ich hoffe, das beantwortet Ihre Frage, ich möchte Sie dringend bitten, etwas über regulatorische DNA zu recherchieren, es ist sehr faszinierend.
Kanadier