Was ist ein Zweistart- oder Zickzackmodell einer 30-nm-Chromatinfaser?

Aus dem von Ihnen verlinkten MB Info Wiki :

Im One-Start-Solenoid-Modell verbindet gebogene Linker-DNA nacheinander alle Nukleosomenkerne und schafft eine Struktur, in der Nukleosomen einander entlang des gleichen helikalen Pfads folgen [4, 7]. Alternativ verbindet im Zickzack-Modell mit zwei Starts gerade Linker-DNA zwei gegenüberliegende Nukleosomenkerne, wodurch die gegenüberliegenden Reihen von Nukleosomen entstehen, die das sogenannte „Zwei-Start“-Modell bilden. Wendel.

Das bedeutet, dass im One-Start-Modell jedes Nukleosom mit dem benachbarten verbunden ist, und dies ist ein kontinuierlicher Zyklus. Das bedeutet, dass es eher wie ein Telefonakkord ist.

Das Zig-Zag-Modell schlägt stattdessen vor, dass jedes Nukleosom mit dem ihm ungefähr gegenüberliegenden Nukleosom (parallel) verbunden ist und ein Muster darstellt, das sich durch die gesamte Chromatinfaser zieht. Dies ist komplizierter zu verstehen, aber stellen Sie sich vor, es wäre eher wie das Schnüren eines Schuhs. Es geht von einem Loch auf der einen Seite zu einem Loch auf der anderen Seite parallel dazu, aber nicht in derselben Ebene wie es selbst.

Um zum dritten Nukleosom zu gelangen (und so dicht wie möglich zu packen), ist es nicht direkt unter dem 1., sondern leicht seitlich versetzt und nicht genau parallel zum 2. Nukleosom.

Das 4. Nukleosom ist jedoch genau parallel zum 3. und somit um die gleiche Anzahl von Graden außermittig vom 2. Nukleosom wie das 3. Nukleosom zum 1., wobei das Muster beibehalten wird.

Dies bildet eine röhrenförmigere 3-D-Struktur als ein tatsächlicher Schnürsenkel an einem Schuh (der flacher ist wie ein Flugzeug, aber als visueller Hinweis dient).

Eine 2D-Schritt-für-Schritt-Darstellung davon würde wie das Bild unten aussehen:

Hier ist ein Modell der endgültigen Figur, die ich erstellt habe, um dies zu erklären:

In der MBI-Abbildung ist jedes „grüne“ Nukleosom mit einem gegenüberliegenden etwas niedrigeren „lila“ Nukleosom verbunden, und dieses violette Nukleosom ist mit einem weiteren grünen verbunden, das leicht außermittig zum ersten grünen Nukleosom liegt:

Theoretisch (nicht sicher, ob richtig): Dies kann bedeuten, dass sich diese Faser beim "Auswickeln" weniger wie eine Feder verhält, die sich löst (wobei sich die gesamte Struktur aufgrund ihrer Verknüpfung aufzulösen beginnt), sondern dass jedes sequentielle Nukleosom gezogen wird weg von der Faser, nachdem sich die Faser, mit der sie verbunden ist, bewegt hat und volle Spannung erfährt.

Stellen Sie sich für das ZigZag-Modell vor, Sie nehmen ein Blatt Papier und falten es viele Male, als wäre es ein Akkordeon. Halten Sie dann das zusammengefaltete Papier in einer Hand. Nimm deine andere Hand und ziehe das Papier von einem Ende, indem du es langsam entfaltest. Sie werden feststellen, dass jede Falte nacheinander herauskommt, während der Rest der Struktur intakt bleibt, bis die Falte sich abflacht, damit die Spannung sie ziehen kann. Zumindest würde das in meinem Kopf passieren. Ich könnte völlig daneben liegen.