Was ist eine Cognate-Enhancer-Sequenz?
Beim Lesen einer Arbeit (1), die in einer Zeitschriftenklasse in der Graduiertenschule präsentiert wurde, stieß ich auf diesen Satz:
HIF-1 bindet an seine verwandte Enhancer-Sequenz, das Hypoxie-responsive Element (HRE), und induziert die Expression verschiedener Gene, die mit der Anpassung des Zellstoffwechsels an Hypoxie (dem Wechsel von oxidativer zu anoxischer Atmung)16 in Verbindung stehen, um der Hypoxie zu entkommen ( Invasion und Metastasierung von Krebszellen),17,18 Verbesserungen der Hypoxie (Angiogenese)19,20 und der Resistenz bösartiger Tumore gegenüber Chemo- und Strahlentherapie.
(1) Ist die Wikipedia-Definition eines Enhancers für diesen Fall richtig? Bedeutet „verwandt“ dann „verwandt mit, tendenziell zusammen gefunden werden“, während „Sequenz“ bedeutet, dass eine Kettenreaktion auftritt?
Y Zhu et al., „ Beteiligung von verminderter Hypoxie-induzierbarer Faktor-1-Aktivität und daraus resultierendem Übergang des G1-S-Zellzyklus in die Radioresistenz von perinekrotischen Tumorzellen “, Oncogene (2013) 32 , 2058–2068
Verwandte Mittel gemeinsamen Ursprungs .
In der Molekularbiologie wird Cognate verwendet, um sich auf bekannte interagierende Paare funktioneller Einheiten zu beziehen. Zum Beispiel bedeutet verwandter Rezeptor eines Liganden den primären (Standard-)Rezeptor, mit dem dieser Ligand interagiert. In ähnlicher Weise beziehen sich verwandte Stellen (die auch Enhancer umfassen) eines Transkriptionsfaktors (TF) auf die gut bekannten und validierten Bindungsstellen des TF.
Siehe auch diesen Beitrag.
David