Was ist eine genomweite Analyse und eine Locus-spezifische Analyse?

Ich lese einige Artikel über genetische Variationen und sehe, dass es zwei Arten von Analysen gibt, eine ist die genomweite genetische Variationsanalyse und die zweite ist eine lokusspezifische genetische Variationsanalyse. Ich verstehe nicht, was diese beiden, die genomweite und die ortsspezifische Analyse, bedeuten und was der Unterschied zwischen diesen beiden Analysen ist, oder warum brauchen wir beide Arten von Analysen?

Antworten (1)

Willkommen bei Biology.SE!

Ein Locus (plur. loci) ist eine Region beliebiger Größe auf einem Chromosom. Ein Locus kann ein einzelnes Nukleotid sein oder viel größer (wie z 10 7 Websites).

Eine genomweite Analyse ist daher eine Analyse, die das gesamte Genom auf einmal verwendet, während eine locusspezifische Analyse die gleiche Analyse ist, die auf der Ebene einzelner Loci durchgeführt wird.

Um eine Analogie zu machen: Wenn eine genomweite Analyse wie eine landesweite Analyse ist, dann ist eine ortsspezifische Analyse wie eine stadtspezifische Analyse.

Ohne mehr Kontext wird es nicht möglich sein, mehr als das zu sagen!

Was ich also verstehe ist, dass genomweite SNP-Analyse die Erkennung von SNPs im gesamten Genom bedeutet, dies gibt uns den Ort des SNP und dann wird diese ortsspezifische Analyse an verschiedenen Personen durchgeführt, um herauszufinden, ob dieser SNP in einer bestimmten Gruppe vorhanden ist von Menschen (z. B. Europa/Asien)?
Ich müsste das Papier lesen, um zu wissen, was sie wirklich getan haben, aber der Begriff "locus-spezifisch" bedeutet nicht "individuenspezifisch" oder "subpopulationsspezifisch", sondern "locus-spezifisch", wobei Locus willkürlich definiert ist genomische Regionen.